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文檔簡介
1、鄭州大學碩士學位論文小兒腎母細胞瘤血清蛋白質標記物檢測及意義姓名:張蛟申請學位級別:碩士專業(yè):小兒外科學指導教師:王家祥20070501鄭州大學2007屆碩士論文小兒腎母細胞瘸j|lL清蛋白質標記物檢測及意義經母細胞瘤9例、肝母細胞瘤5例、胰母細胞瘤2例、腹膜后惡性畸胎瘤5例、橫紋肌肉瘤3例、腎上腺皮質癌1例),正常對照組20例。所有惡性腫瘤標本均經病理證實。腎母細胞瘤組男16例,女14例,平均年齡2801歲。其他小兒腹部實體腫瘤組男1
2、l例,女14例,平均年齡3501歲。正常對照組與腎母細胞瘤組年齡、性別相匹配。12設備表面增強激光解析電離一飛行時間質譜(SurfaceEnhancedLaserDesorptionflonizationTimeofFlightMassSpectrometry,SELDlTOFMS),PBSⅡCiphergenInc美國)。主要參數:收集范圍為1000—50000;優(yōu)化范圍為2000—3000013芯片弱陽離子交換(WCX2)蛋白芯片。
3、14應用軟件和標記物評價指標應用軟件:ProteinchipSoRware31,BiomarkerWizard和ZUCIProteinChipDataAnalyzeSystem軟件包。支持向量機(svM):MATLAB650SUSVM工具箱。評價實驗的指標:靈敏度、特異性、Youden指數。2方法21血清樣本處理:U9溶液處理冰浴中解凍的血清標本,lOOMraNaNC(PH=4)稀釋后,和Bioprocessor預處理過的WCX2蛋白芯
4、片結合反應60min,上述NaNC緩沖液清洗芯片,取出芯片風干后點50%飽和的SPA溶液,上機讀片22SELDI操作:SELDI質譜儀完成設置后,記錄每一例樣本的血清蛋白質質譜圖。原始數據先用ProteinchipSoftware31做校正,使總離子的強度及分子量均一化。用BiomarkcrWizard和ZUCIProtdnChipDataAnalyzeSystem軟件包過濾噪音局部極值的方法找出樣本各自的峰,并過濾信噪比小于2的峰,以
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