調(diào)控頭頸鱗癌放療敏感性的lncRNA初步篩選.pdf

1、《中國圖書資料分類法》分類號：單位代碼：10660學(xué)號：S120213貴陽醫(yī)學(xué)院貴陽醫(yī)學(xué)院20142014屆碩士學(xué)位論文屆碩士學(xué)位論文調(diào)控頭頸鱗癌放療敏感性的lncRNA初步篩選ScreeningPredictinglncRNAwhichmayregulateradiosensitivityinHeadnecksquamouscelllines研究生：易燭光導(dǎo)師：龔正鵬年級：2012級專業(yè)：耳鼻咽喉科2014年02月28日貴陽醫(yī)學(xué)院20

2、14屆碩士研究生論文2調(diào)控頭頸鱗癌放療敏感性的lncRNA初步篩選摘要：摘要：目的：目的：應(yīng)用高通量長鏈非編碼RNA（lncRNA）芯片初步篩選頭頸鱗癌SCCⅦ細胞株放射前后差異表達的lncRNA，并對其通過生物信息學(xué)分析差異表達lncRNA及其靶基因，為尋找靶向調(diào)控DNADSB修復(fù)的lncRNA提供前期基礎(chǔ)。方法方法：分別提取SCCⅦ細胞株放療前后的RNA，體外逆轉(zhuǎn)錄制備并標(biāo)記為雙鏈cDNA（dscDNA），與含有33231條lncR

3、NA的芯片進行雜交，篩選差異表達的lncRNA，利用CIS法和Trans法篩選靶基因，借助DAVID分析軟件中的KEGG分析等方法挖掘數(shù)據(jù)，找到相關(guān)通路，得到預(yù)測目標(biāo)lncRNA。結(jié)果結(jié)果：篩選出SCCⅦ細胞株中差異表達的lncRNA共1280條，其中在腫瘤組織中高表達的lncRNA共885條，低表達的lncRNA共395條（變化2倍）。通過KEGG信息分析認為:lncRNA對應(yīng)的靶基因富集于3條通路“腫瘤相關(guān)通路(Pathwaysin

4、cancer)”、“Wnt信號通路(Wntsignalingpathway)“和“軸突導(dǎo)向通路(Axonguidance)”信號通路(q0.05)。結(jié)論：結(jié)論：①細胞株放療前后存在lncRNA的表達差異并由此建立頭頸鱗癌放療相關(guān)lncRNA表達譜。②PRKCASTAT5B很可能是控制頭頸鱗癌放療反應(yīng)敏感性的標(biāo)志物，因此考慮與之對應(yīng)的兩個lncRNA：SEQ—ID為162033和SEQID為312383，也可能作為控制頭頸鱗癌放療反應(yīng)敏感