版權說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權,請進行舉報或認領
文檔簡介
1、蛋白質(zhì)磷酸化在細胞生長、分化、凋亡整個過程中扮演至關重要的角色。磷酸化蛋白質(zhì)的特定位點能起到開關該蛋白質(zhì)某種功能的目的,從而實現(xiàn)在不同生物過程中該蛋白發(fā)揮不同作用的目的。這一過程是通過磷酸激酶催化來實現(xiàn)的。同時,磷酸激酶的催化作用也可以被抑制劑終止,以阻止磷酸激酶對蛋白質(zhì)的磷酸化。研究表明,磷酸化異常是導致人類疾病的重要原因之一,通過抑制劑終止磷酸激酶的催化作用,將異常磷酸化功能阻斷,可以實現(xiàn)疾病治療。因此,磷酸激酶及其抑制劑的交互作用
2、是當今病理學和生物信息學研究的熱門問題之一。
現(xiàn)有與磷酸激酶研究相關的算法主要集中于磷酸位點的預測,然而大多已預測的磷酸肽的磷酸激酶信息未知。而且現(xiàn)有算法在閾值選取及窗口長度劃分問題上多采用定值,導致算法只能處理部分數(shù)據(jù),而對另外部分數(shù)據(jù)失效。除此之外,磷酸激酶信息的缺失,對抑制劑的篩選影響很大。鑒于此,本文旨在設計有效算法確定催化蛋白質(zhì)的磷酸激酶,以及能與磷酸激酶相互作用從而終止磷酸化過程的抑制劑。本文研究主要工作如下:
3、r> (1)針對磷酸激酶信息缺失的問題,設計了基于貝葉斯的磷酸激酶預測算法。該算法結(jié)合信息熵及大津法篩選磷酸肽有效位點,在最佳窗口長度下,通過計算磷酸激酶信息缺失的磷酸肽序列貝葉斯條件概率,預測其最可能的磷酸激酶。
(2)針對磷酸激酶抑制劑維度很高的問題,設計了基于GSVM的磷酸激酶抑制劑篩選算法。該算法通過粒度劃分,準確篩選磷酸激酶-抑制劑特征,從而提高分類性能。同時,利用Platt Scaling計算樣本權重,構造帶權分
4、類算法進一步提高分類性能。
(3)針對磷酸激酶-抑制劑正樣本較少,未標記樣本很多的情況,本文對磷酸激酶抑制劑篩選算法采用了半監(jiān)督學習算法(PU learning)建模。PU learning算法設計初衷就是處理正樣本較少、未知樣本很多的問題,因此能很好的預測磷酸激酶-抑制劑結(jié)合問題。同時,該研究把PU learning算法與GSVM相結(jié)合,構造多級分類器,提高了對未標記磷酸激酶-抑制劑交互作用分類的性能。
實驗結(jié)果表
溫馨提示
- 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
- 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權益歸上傳用戶所有。
- 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會有圖紙預覽,若沒有圖紙預覽就沒有圖紙。
- 4. 未經(jīng)權益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
- 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護處理,對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內(nèi)容負責。
- 6. 下載文件中如有侵權或不適當內(nèi)容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
- 7. 本站不保證下載資源的準確性、安全性和完整性, 同時也不承擔用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。
最新文檔
- 磷酸化蛋白質(zhì)分析方法研究及其在人胎肝磷酸化蛋白質(zhì)組研究中的應用.pdf
- 蛋白質(zhì)磷酸化模式挖掘算法研究.pdf
- 基于多特征的蛋白質(zhì)磷酸化預測算法研究.pdf
- 羊肉嫩度的磷酸化蛋白質(zhì)組分析.pdf
- 生物質(zhì)譜分析蛋白質(zhì)磷酸化位點
- 小鼠與人睪丸磷酸化蛋白質(zhì)組學研究.pdf
- 食鹽腌制對肌肉蛋白質(zhì)磷酸化的影響.pdf
- 2334.蛋白質(zhì)磷酸化與疾病關系抽取研究
- 基于新型功能化納米材料的磷酸化蛋白質(zhì)分離分析新方法研究.pdf
- 功能化復合納米材料的磷酸化蛋白質(zhì)和糖基化蛋白質(zhì)分析新方法研究.pdf
- 磷酸化蛋白質(zhì)組學定性與定量分析技術的研究及在肝細胞磷酸化蛋白質(zhì)組學中的應用.pdf
- 蛋白質(zhì)磷酸化調(diào)控肉色穩(wěn)定性的作用機制.pdf
- 水稻蛋白質(zhì)磷酸化位點預測SVM工具的研發(fā).pdf
- 水稻響應鎘脅迫的差異磷酸化蛋白質(zhì)組研究.pdf
- 磷酸化調(diào)控蛋白質(zhì)構象變化的理論研究.pdf
- 蜜蜂工蜂和雄蜂胚胎期發(fā)育蛋白質(zhì)組及磷酸化蛋白質(zhì)組研究.pdf
- 植物磷酸化蛋白質(zhì)組的生物信息學分析.pdf
- 哺育蜂和采集蜂大腦磷酸化蛋白質(zhì)組研究.pdf
- 王漿高產(chǎn)蜜蜂咽下腺發(fā)育磷酸化蛋白質(zhì)組分析.pdf
- 磷酸化蛋白質(zhì)組學技術平臺建立及其初步應用.pdf
評論
0/150
提交評論