雞leT-7a的組織表達、功能預測及其靶基因ADIPOR2遺傳效應分析.pdf

1、let-7家族是最早被發(fā)現(xiàn)的在物種間高度保守的廣泛性表達miRNA，在腫瘤細胞的增殖、分化、脂肪生成及藥物敏感性等方面發(fā)揮重要調控作用。前期我們采用Solexa高通量測序技術構建了固始雞1日齡和36周齡兩個發(fā)育階段下丘腦的miRNA表達譜，分析發(fā)現(xiàn)let-7家族的8個成員在雞下丘腦發(fā)育過程均呈高豐度差異性表達，尤其是let-7a，這表明let-7家族的miRNA在雞下丘腦發(fā)育過程可能發(fā)揮重要調節(jié)作用。但目前有關雞let-7a功能的研究尚

2、未見報道。
　　本研究采用實時定量PCR檢測了let-7a在固始雞14日齡胚胎、17日齡胚胎、1日齡雛雞和36周齡成年雞的13種不同組織中的表達情況;利用兩種算法預測了let-7a的靶基因，并對共有靶基因進行了GO富集分析和KEGG通路分析;根據(jù)生物信息學分析結果，利用實驗室固始雞-安卡雞資源群體素材，探討了let-7a靶基因脂聯(lián)素受體2 Adiponectin receptor2(ADIPOR2)的遺傳效應，分析了該基因的時序表

3、達特征及其SNP與雞生產(chǎn)性狀間的關聯(lián)性，主要結果如下:
　　1.let-7a在所檢測的組織中呈廣泛性表達，其在下丘腦中的表達趨勢與高通量測序結果一致;但組織間的表達量卻存在較大的差異。14日胚齡和17日胚齡時，在腦組織和內(nèi)臟組織中表達量均較高;1日齡時，let-7a在下丘腦、小腦、胸肌、肌胃和腎臟等組織中高豐度表達，在肺中低豐度表達，其它組織中適度表達;36周齡時，let-7a在各組織中的表達量均相對較低。
　　2.對let

4、-7a的107個預測的靶基因進行了GO富集分析和KEGG通路分析，結果顯示靶基因主要在生物學過程調節(jié)相關的生物學過程中富集，尤其是與礦物質和磷代謝相關的調節(jié)過程;且在粘著斑、細胞外基質受體互作、MAPK信號通路等3個通路中顯著富集(P＜0.01)。
　　3.let-7a預測的靶基因ADIPOR2在雞不同生長階段不同組織中廣泛性表達。隨著生長發(fā)育，ADIPOR2在大腦和肌胃兩種組織中的表達水平與let-7a的表達水平變化趨勢是相反的

5、;在肺中，兩者表達水平變化趨勢一致;但在腎臟和小腦等其它10種被檢測的組織中，兩者表達水平的變化趨勢沒有呈現(xiàn)明顯的對應關系。這些結果表明，let-7a和ADIPOR2基因在大腦和肌胃發(fā)育過程存在潛在的互作關系。
　　4.對let-7a潛在靶基因ADIPOR2的SNP關聯(lián)分析結果表明，g.34490C＞T突變與肝臟重和血液球蛋白顯著相關（P＜0.05），g.35363T＞C與6、10和12周齡體重顯著相關(P＜0.05)，這兩個多態(tài)