微衛(wèi)星標記應(yīng)用于克氏原螯蝦的半同胞家系分析和親子鑒定.pdf

1、本文選用10個微衛(wèi)星位點對克氏原螯蝦的半同胞家系進行分析和親子鑒定，首先用10個微衛(wèi)星位點對隨機選取48個克氏原螯蝦個體進行多態(tài)性檢測，計算出48個個體在10個微衛(wèi)星位點基因座上的平均觀測雜合度0.3455，平均期望雜合度為0.6224，平均香農(nóng)指數(shù)為1.1335，平均多態(tài)信息含量是0.5656，根據(jù)檢測結(jié)果，獲得了個體之間的遺傳距離并且繪制了UPGMA聚類分析圖，結(jié)果表明基于克氏原螯蝦的這10個微衛(wèi)星位點的多態(tài)性可以測量出各個個體間的

2、遺傳距離，這10個微衛(wèi)星位點可以應(yīng)用于克氏原螯蝦遺傳多樣性的分析。
　　在半同胞家系分析中，人工建立半同胞家系，對隨機選取的成年的三個雌蝦和兩個公蝦放入同一個水缸內(nèi)讓其自由交配，三個雌蝦分別抱卵后，從這三個家系中分別取14、14、15個子代及對應(yīng)的親本進行3個微衛(wèi)星位點的基因型檢測，對檢測結(jié)果利用GERUD2.0軟件分析，顯示第一個半同胞家系內(nèi)的子代最少有兩個父本，第二個半同胞家系內(nèi)的子代最少有三個父本，第三個半同胞家系內(nèi)的子代最

3、少有四個父本，證明了克氏原螯蝦的交配方式是一對多進行的，同時也說明在實驗前，雌蝦已經(jīng)和其他雄蝦交配過。
　　在親子鑒定的實驗中，實驗材料為在半同胞家系實驗中的材料，由于一個雌蝦可以和多個雄蝦進行交配，產(chǎn)生的后代可以有多個父本，1號和2號為可疑父本，3號為第一個母本，從4號到17號為3號的子代，18號為第二個母本，19號到32號為18號的子代，33號為第三個母本，34號到48號為33號的子代。利用CERVUS3.0軟件計算這10個微

4、衛(wèi)星位點的觀測雜合度范圍為0.354-0.896，期望雜合度范圍為0.588-0.807，平均期望雜合度為0.7193，多態(tài)信息含量為0.521-0.767，平均多態(tài)信息含量為0.6662，平均每個位點有5.6個等位基因。測量這10個微衛(wèi)星位點親子排除率是:當兩個親本基因型未知時，則測得每一個位點的親本排除率(E-1P)范圍是0.177-0.417;當一個親本基因型已知時，測得另一個親本的排除率(E-2P)范圍是0.325-0.596;

5、測得一對親本組合的雙親排除率(E-PP)是0.487-0.794，則10個微衛(wèi)星位點的第一親本累計非父排除概率是0.97616685，第二親本的累計非父排除概率是0.99869019，雙親的累計排除概率是0.99998479。進一步的模擬分析，當雙親性別知道時，模擬子代選取10000個，候選母本是3，候選父本是2，親本和子代的模擬配對率為100％;在雙親性別未知時，以100％的鑒定率和95％的置信度標準下，這10個微衛(wèi)星位點可在最多有4

6、5個親本并且雙親未知的情況下做親子鑒定，已經(jīng)滿足了大多數(shù)的同塘繁育實驗需求。在親權(quán)鑒定時，結(jié)果顯示兩個可疑父本都不是這43個子代的親生父本，這43個子代都找到了母本，4號到17號這14個子代的母本是3號個體，19號到32號這14個子代的母本18號個體，34號到48號這15個子代的母本是33號個體。測量這48個克氏原螯蝦的遺傳距離，然后根據(jù)遺傳距離繪制了UPGMA聚類分析圖也證明了這兩個可疑父本不是仔蝦的生父，親權(quán)鑒定結(jié)果和UPGNA聚類

7、分析圖相符合，表明這10個微衛(wèi)星位點可以應(yīng)用于克氏原螯蝦的親子鑒定。
　　基于獲得的三個半同胞家系遺傳分析數(shù)據(jù)，本文提出了一種有效的鑒別克氏原螯蝦不同家系的分子標記方法，在前述親子鑒定的實驗中我們得出三個半同胞家系的親本沒有任何關(guān)系，是完全獨立的三個半同胞家系，我們用遺傳分析軟件Population軟件分析這三個家系個體之間的遺傳距離并構(gòu)建UPGMA進化樹，通過Population軟件計算出半同胞家系或全同胞家系個體之間的遺傳距離