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1、傳統(tǒng)的根瘤菌群體遺傳學(xué)研究主要來源于對分離自不同地區(qū)的同種宿主植物或同一地區(qū)的不同宿主植物的根瘤菌之間的表型與遺傳性狀差異的比較分析。內(nèi)源質(zhì)粒是根瘤菌基因組的重要組成部分,含有大量的遺傳信息,費(fèi)氏中華根瘤菌與共生有關(guān)的基因就位于共生質(zhì)粒上,質(zhì)粒還是開展根瘤菌基因重組和水平轉(zhuǎn)移研究的熱點。在傳統(tǒng)的根瘤菌群體多樣性研究中,根瘤菌質(zhì)粒類群的劃分多采用質(zhì)粒數(shù)量、大小和共生基因定位等指標(biāo),難以反映質(zhì)粒本身的性質(zhì)。復(fù)制子類型一直是細(xì)菌質(zhì)粒分類的重要
2、依據(jù),本研究對費(fèi)氏中華根瘤菌質(zhì)粒復(fù)制基因repC的類型進(jìn)行了比較研究。主要研究結(jié)果包括: 1.采用質(zhì)粒快速檢測法從供試33株S.fredii中分別檢測出2至4個內(nèi)源大質(zhì)粒。2.用RC1/RC3引物從32株供試費(fèi)氏中華根瘤菌、3株華癸中生根瘤菌和1株大豆慢生根瘤菌中擴(kuò)增到750bp左右的repC基因片段,表明在費(fèi)氏中華根瘤菌中普遍存在repC基因,并大多含有repABC家族的質(zhì)粒。 3.通過對擴(kuò)增產(chǎn)物的序列分析和與已報道的
3、repC基因序列進(jìn)行聚類分析,供試菌株可分為小群IBa和小群Ⅱb兩個小群,雖然群內(nèi)菌株的堿基序列十分保守、但群間差異明顯。小群IBa與已報道的repC基因序列的同源性較高,但小群Ⅱb的序列與已知repC基因的差異明顯。與根據(jù)16SrDNA序列分析和RFLP等性狀進(jìn)行的群體聚類分析結(jié)果比較,repC基因的多樣性與宿主植物、土樣來源和在土壤中是否為優(yōu)勢菌沒有明確的相關(guān)性,與供試菌株的已檢測的表型性狀也沒有緊密聯(lián)系。4.用小群IBa和Ⅱb中代
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