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文檔簡介
1、本論文綜述了根瘤菌多樣性、分類和多相分類技術(shù)的研究進(jìn)展;采用表型分析(153項(xiàng)生理生化測定,數(shù)值分類)和遺傳型分析(16SrDNAPCR-RFLP,23SrDNAPCR-RFLP,IGSPCR-RFLP,16SrRNA基因全序列分析)等多相分類技術(shù),對分離自我國陜西省太白金礦尾礦廢棄地根瘤菌,首次系統(tǒng)進(jìn)行了多相分類和系統(tǒng)發(fā)育研究。 對陜西省太白金礦尾礦廢棄地根瘤菌進(jìn)行了豆科植物根瘤菌資源的調(diào)查和采集,涉及豆科植物7屬8種,分離純
2、化得到166株根瘤菌,斜面保存和甘油超低溫冰箱保藏,豐富了根瘤菌資源庫,為我國西部地區(qū)根瘤菌資源研究和開發(fā)奠定了基礎(chǔ)。 以研究陜西省太白金礦尾礦區(qū)根瘤菌的資源多樣性和重金屬、苯酚抗逆性菌株的篩選為目的,選取分離自尾礦廢棄地及太白河邊的8種豆科植物的108株根瘤菌及42株參比菌株,進(jìn)行了生長溫度范圍,唯一碳源、氮源利用,生長初始pH,耐鹽性,重金屬和苯酚的抗性等151項(xiàng)表型性狀分析。結(jié)果表明,供試根瘤菌的表型特性存在明顯差異,在8
3、5%的相似水平上供試菌株聚成5個群,其中群1有26株菌,主要分離自天藍(lán)苜蓿(Medicagolupulina);群2有12株菌,其寄主各不同;群3有3株菌,寄主均為金翼黃芪(Astragaluschrysopterus);群4有40株菌,主要分離自金翼黃芪;群5有4株菌,寄主均為截葉鐵掃帚(Lespedezacuneata)。群Ⅳ與已知種R.mongolense聚在一起,其它4個類群未與參比菌株聚在一起,可能是新的表觀群,其分類地位需進(jìn)
4、一步確定。一些菌株表現(xiàn)了較強(qiáng)的抗重金屬和苯酚毒性的能力,其中1株菌能耐受0.15mmol/L的Hg2+,4株菌能耐受0.4mmol/L的Cu2+,3株菌能耐受1.6mmol/L的Zn2+,5株菌能耐受900mg/L的苯酚。 16SrDNAPCRRFLP聚類樹狀結(jié)果表明,所有菌株在大約85%的相似水平上根瘤菌聚成3個遺傳群,其中群1由包括2株快生根瘤菌參比菌株RhizobiumtropicitypeB和Rhizobiumindig
5、oferae在內(nèi)的34株菌組成,具有1種遺傳型,它們在數(shù)值分類中全部位于第4表觀群;群2的4株供試菌株在85%的水平上獨(dú)立成為1個新群,具有4種不同的遺傳型,它們在數(shù)值分類中并未聚在同一個群中;群3由7株供試菌株組成,具有同一遺傳型,但這7株供試菌株在數(shù)值分類中分別位于表觀群2和表觀群3中。綜合起來,分離自馬棘、金翼黃芪的44株供試菌株共產(chǎn)生了9種遺傳型。 23SrDNAPCRRFLP聚類樹狀圖中看出,所有供試菌株在大約83%的
6、相似水平上聚成2個遺傳群,其中群1包括37株菌,有11種遺傳型;群2包括7株供試菌株,有4種遺傳型。這44株供試菌株的聚類結(jié)果與數(shù)值分類結(jié)果以及16SrDNAPCRRFLP聚類結(jié)果相比較,存在一定的差異。綜合起來,分離自馬棘、金翼黃芪的44株供試菌株共產(chǎn)生了17種遺傳型。 IGSrDNAPCRRFLP聚類樹狀圖所示,所有供試菌株在80%相似水平上分成2個群,群1由42株供試菌株構(gòu)成,在90%的相似水平上分成2個亞群。亞群1由34
7、供試菌株組成,其在99%的水平上分為兩種遺傳型;亞群2由5株供試菌株組成,有2種遺傳型;群2組成一個獨(dú)立的新表觀群;群3由22參比菌株組成,在75%的相似水平上這些菌株分成了3個亞群。綜合起來,分離自馬棘、金翼黃芪的44株供試菌株共產(chǎn)生了14種遺傳型。 16S-23SrDNAPCRRFLP聚類樹狀圖所示,在大約83%的相似水平上供試菌株聚成2個遺傳群,這些結(jié)果與16SrDNAPCRRFLP聚類結(jié)果相當(dāng)吻合;群2的4株待測菌株在8
8、5%的水平上獨(dú)立成為1個新群,它們在數(shù)值分類并未聚在同一個群中。 在16SrDNA全序列系統(tǒng)發(fā)育樹中3個代表菌株分布于2個系統(tǒng)發(fā)育分支上,其中代表菌株CCNWTB64-1,CCNWTB66-1位于根瘤菌屬(Rhizobium)的分支,其與菌株R.sullaeIS123,R.gallicumR602,R.mongolenseUSDA1844,R.yanglingenseCCBAU71623,R.indigoferaeCCBAU71
9、042的序列同源性分別為98.3%,98.1%,98.0%,97.5%,97.3%;CCNWTB81-2位于Agrobacterium-Rhizobium交叉分支,其與參比菌株Ag.rubiIF013261的同源性最高為92.4%。代表菌株的16SrDNA序列分析結(jié)果與16SrDNAPCRRFLP的結(jié)果是一致的。研究發(fā)現(xiàn),分離自同一區(qū)域的同種金翼黃芪植物的根瘤菌CCNWTB64-1,CCNWTB66-1和CCNWTB81-2位于不同的分
10、支,這表明與金翼黃芪共生的根瘤菌具有明顯的多樣性,也進(jìn)一步證明了在不同的地理、氣候條件下,與同一種宿主共生的根瘤菌可以是不同屬種的根瘤菌。 苯酚降解的動力學(xué)研究表明:當(dāng)苯酚濃度低于2998μM時,細(xì)胞生長不會受到苯酚的影響,相反,隨著濃度的升高而生長速率不斷加大。而當(dāng)苯酚濃度高于2998μM時,細(xì)胞生長受到苯酚抑制。從苯酚降解的最大速率可得出當(dāng)苯酚濃度低于3240μM時苯酚降解的速率呈現(xiàn)不斷增大的趨勢,而高于3240μM時,苯酚
11、降解的速率不斷降低。 多底物利用研究表明:對羥基苯甲酸,間苯三酚,肉桂酸,苯甲酸,苯酚等5種酚類化合物均可被CCNWTB70-1作為生長所必需的唯一碳源來利用,但是各種碳源之間存在差異性,其中以苯甲酸為最好,而間苯三酚為最差。 在以苯酚為底物的情況下,CCNWTB70-1菌株的鄰苯二酚1,2-雙加氧酶比活為1.3285units.mg-1,未測到鄰苯二酚2,3—雙加氧酶活性,表明CCNWTB70-1菌株降解這些芳烴化合物
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