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文檔簡(jiǎn)介
1、冠心病是最常見的心血管疾病之一,是由環(huán)境因素和遺傳因素相互作用引起的一類復(fù)雜性多基因遺傳性疾病。近年來,隨著基因測(cè)序技術(shù)突飛猛進(jìn)的發(fā)展以及越來越廣泛的應(yīng)用,單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisma,SNP)已成為醫(yī)療技術(shù)研究的熱點(diǎn)。尤其自2007年以來,全基因組關(guān)聯(lián)研究(genome-wideassociation study,GWAS)已發(fā)現(xiàn)與冠心病發(fā)病相關(guān)的多個(gè)多態(tài)性位點(diǎn),為冠心病的易感人群及患
2、者的預(yù)防、診斷及治療提供了新的依據(jù)。但這些多態(tài)性位點(diǎn)對(duì)不同的人群冠心病的影響尚不清楚,大多數(shù)位點(diǎn)影響冠心病發(fā)生的機(jī)制尚不明確。本文根據(jù)GWAS的研究結(jié)果篩選出了rs515135、rs1122608、rs6544713、rs216172這四個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行冠心病基因單核苷酸多態(tài)性研究。與這四個(gè)位點(diǎn)相關(guān)的基因分別為APOB基因,LDLR基因,ABCG5-ABCG8基因,SMG6基因。
目的:
本研究目的在于對(duì)延邊漢族人群rs5
3、15135、rs1122608、rs6544713、rs216172四個(gè)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)進(jìn)行分析,探討這四個(gè)SNPs位點(diǎn)的等位基因頻率、基因型頻率與冠心病易感性的相關(guān)性,同時(shí)研究SNPs位點(diǎn)與臨床各參數(shù)的相關(guān)性,從而為進(jìn)一步明確延邊漢族人群冠心病的發(fā)病機(jī)制、評(píng)估冠心病病變程度以及判斷冠心病預(yù)后提供新的治療目標(biāo)。
方法:
1.研究對(duì)象
本文采用病例對(duì)照研究方法,收集延邊地區(qū)漢族冠心病患者及其同期年齡、性別相
4、匹配的正常漢族人群共405例。其中病例組標(biāo)本204例,選自2014年3月至2015年11月的漢族冠心病患者,其在延邊大學(xué)附屬醫(yī)院心血管內(nèi)科確診并住院治療,年齡34-81歲,平均年齡64.7±9.9歲,男119例,女85例。選擇同期在延邊大學(xué)附屬醫(yī)院體檢科健康體檢的漢族正常人群為對(duì)照組,共201例,年齡50-88歲,平均年齡64.8±9.3歲,男111例,女90例。
2.候選基因和SNPs位點(diǎn)的選擇
本文研究意在根據(jù)G
5、WAS在冠心病易感性中的研究結(jié)果.同時(shí)結(jié)合查閱大量相關(guān)文獻(xiàn),共篩選出rs515135、rs1122608、rs6544713、rs216172這四個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行研究。
3.SNPs位點(diǎn)檢測(cè)方法
采用基于熒光標(biāo)記單堿基延伸原理的SNaPshot技術(shù)進(jìn)行SNP的分型檢測(cè),檢測(cè)過程主要包括引物設(shè)計(jì)合成、DNA提取、預(yù)擴(kuò)增、預(yù)擴(kuò)增產(chǎn)物純化、延伸反應(yīng)、延伸產(chǎn)物純化,最后上機(jī)檢測(cè)進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。
結(jié)果:
(1)臨床
6、參數(shù)
冠心病組204例,平均年齡64.7±9.9歲,其中男119例,女85例。正常對(duì)照組共201例,平均年齡64.8±9.3歲,男111例,女90例。兩組別之間高血壓、吸煙史、HDL、LDL有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),而年齡、性別、BMI、收縮壓、舒張壓、糖尿病史、TG、TC無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
(2)Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)
APOB基因rs515135位點(diǎn)、LDLR基因rs1122608位點(diǎn)、S
7、MG6基因rs216172位點(diǎn)這3個(gè)SNP均符合Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn),表明本研究所選取的樣本具有較好的群體代表性。
(3)冠心病組與對(duì)照組之間的相關(guān)分析結(jié)果
?、賰山M間等位基因頻率的相關(guān)分析:LDLR基因的rs1122608位點(diǎn)的等位基因頻數(shù)在冠心病組和對(duì)照組之間有顯著的統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P=0.005,P<0.01)
?、趦山M間基因型頻率的相關(guān)分析:SMG6基因的rs216172位點(diǎn)的三種基因型頻率
8、在冠心病組和對(duì)照組之間有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P=0.009,P<0.05),說明該位點(diǎn)與冠心病有關(guān)聯(lián)。
?、蹆山M間基因模型模擬的基因型頻率的相關(guān)分析:通過模擬基因模型,當(dāng)SMG6基因的rs216172位點(diǎn)的等位基因G為顯性遺傳時(shí),在GC+GG型與CC型兩組之間有顯著性差異(P=0.004,P<0.01)。
(4)不同基因型間臨床參數(shù)的比較
對(duì)這4個(gè)SNP位點(diǎn)在BMI、收縮壓、舒張壓、TC、TG、HDL、LDL間比較,
9、統(tǒng)計(jì)分析應(yīng)用單因素方差分析,所得結(jié)果4個(gè)SNP位點(diǎn)的不同基因型間在這些臨床參數(shù)均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
(5)4個(gè)SNP位點(diǎn)與心肌梗死的相關(guān)分析
APOB基因的rs515135位點(diǎn)的三種基因型頻率在MI組和非MI組兩組之間有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P=0.047,P<0.05),說明該位點(diǎn)與MI有關(guān)聯(lián)。
(6) CAD相關(guān)的危險(xiǎn)因素分析
rs216172、高血壓、LDL與冠心病的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)(P<0.05),有統(tǒng)計(jì)學(xué)
10、差異;而OR值分別為1.479、1.737、1.782,是冠心病的危險(xiǎn)因素。
結(jié)論:
對(duì)于延邊地區(qū)漢族人群中實(shí)驗(yàn)研究結(jié)論:
1.SMG6基因的rs216172位點(diǎn)(C/G)與冠心病的發(fā)病有相關(guān)性,其CC基因型可能對(duì)冠心病發(fā)病起保護(hù)性作用。
2.LDLR基因的rs1122608位點(diǎn)(G/T)的T等位基因是冠心病的保護(hù)性基因。
3.APOB基因的rs515135位點(diǎn)(G/A)與心肌梗死發(fā)病相
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