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文檔簡介
1、我們針對(duì)生物序列中短串組成的進(jìn)化提出了一個(gè)試探性的概率模型，將序列之間短串組成的關(guān)聯(lián)與序列分歧度聯(lián)系起來。此模型解釋了基于短串組成的系統(tǒng)發(fā)生方法的有效性，并被用來標(biāo)度組分矢量方法(CVTree)的結(jié)果和估計(jì)其參數(shù)--短串長度K--的工作范圍。它顯示CVTree可以被推廣為一族方法，并可由此使用更大的K值。我們發(fā)展了兩組獨(dú)立的距離估計(jì)方法，僅僅依賴于K串存在與否的信息，它們產(chǎn)生的系統(tǒng)發(fā)生樹與當(dāng)前的分類學(xué)知識(shí)高度一致。
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