人類及酵母基因組功能區(qū)的核小體定位預(yù)測.pdf

1、核小體是構(gòu)成真核生物染色質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)單位。核小體在基因組DNA序列上的精確定位稱為核小體定位。核小體定位在DNA復(fù)制、修復(fù)和轉(zhuǎn)錄調(diào)控等細(xì)胞過程中起著重要的作用。核小體定位已成為目前表觀遺傳學(xué)研究的熱點問題。文章包括以下3方面：
　　1、隔離子是染色體上能夠保護(hù)基因免受其外部增強(qiáng)子和非活性染色質(zhì)結(jié)構(gòu)影響的DNA序列。計算了隔離子區(qū)的GC含量，統(tǒng)計分析了隔離子起始位點與終止位點上下游1000bp范圍內(nèi)核小體的平均占據(jù)。結(jié)果顯示，隔離子

2、區(qū)序列的GC含量高，隔離子區(qū)域核小體的平均占據(jù)比兩翼的核小體平均占據(jù)高，表明：序列中GC含量高DNA序列易發(fā)生彎曲和組蛋白八聚體形成致密的核小體，而隔離子區(qū)核小體占據(jù)率高有利于序列中兩個轉(zhuǎn)錄功能域的隔離。
　　2、啟動子是啟動基因轉(zhuǎn)錄的一段DNA序列，是RNA聚合酶的識別位點。啟動子是基因轉(zhuǎn)錄必不可少的元件，而核小體的排布影響基因轉(zhuǎn)錄。啟動子區(qū)缺乏核小體時，RNA聚合酶結(jié)合啟動子轉(zhuǎn)錄才能得以進(jìn)行。我們計算了酵母啟動子上下游區(qū)域的核