以脯氨酸為端基的ACE抑制三肽定量構(gòu)效關(guān)系及分子作用機(jī)制研究.pdf_第1頁(yè)
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1、血管緊張素轉(zhuǎn)化酶(ACE)是人體內(nèi)調(diào)節(jié)血壓的重要酶類,是眾多抗高血壓藥物的作用靶點(diǎn)。生物小肽類ACE抑制劑因其毒副作用小,易吸收等特性而受到廣泛關(guān)注。本論文對(duì)以脯氨酸為端基的ACE抑制三肽進(jìn)行定量構(gòu)效關(guān)系研究,通過(guò)模型篩選出具有良好活性的抑制肽進(jìn)行體外活性驗(yàn)證,同時(shí)采用分子動(dòng)力學(xué)模擬和核磁共振波譜實(shí)驗(yàn)對(duì)新的典型活性抑制肽進(jìn)行分子作用機(jī)制研究,對(duì)分子活性作用機(jī)制給出微觀解釋。論文分為以下四個(gè)部分:
  論文第二章選用Z-scales

2、,ISA-ECI,MS-WHIM三種氨基酸描述符,采用偏最小二乘法(PLS)分別對(duì)38個(gè)以脯氨酸為碳端端基的ACE抑制三肽進(jìn)行定量構(gòu)效關(guān)系研究,其中以Z-scales氨基酸描述符建立的模型明顯優(yōu)于另外兩者,其留一驗(yàn)證系數(shù)(Q2oo)為0.782,外部驗(yàn)證系數(shù)(Q2x)為0.824,復(fù)相關(guān)系數(shù)(R2)為0.857。表明該模型具有良好的穩(wěn)定性和預(yù)測(cè)能力。采用該模型篩選了10個(gè)具有潛在ACE抑制活性的三肽,合成其中四個(gè)(IIP,IVP,VIP

3、,IGP)對(duì)模型進(jìn)行進(jìn)一步驗(yàn)證。
  論文第三章對(duì)檢測(cè) ACE抑制活性的直接吸光度值法進(jìn)行改進(jìn),將其檢測(cè)波長(zhǎng)由474nm改為492nm,將喹啉和苯磺酰氯的比率由3:1改為8:1。采用改良后的直接吸光度法對(duì)上述四個(gè)合成的三肽的ACE抑制活性進(jìn)行體外實(shí)驗(yàn)測(cè)定,IIP的預(yù)測(cè)活性與實(shí)驗(yàn)值最為接近,兩者的相對(duì)誤差僅為2.51%,其次為IVP,預(yù)測(cè)值與實(shí)驗(yàn)值的相對(duì)誤差為14.69%,然后是IGP與VIP,他們的預(yù)測(cè)值與實(shí)驗(yàn)值的相對(duì)誤差分別是2

4、3.20%和48.57%。上述四個(gè)三肽的實(shí)驗(yàn)活性值與模型預(yù)測(cè)活性值相接近,進(jìn)一步證明了定量構(gòu)效關(guān)系模型的預(yù)測(cè)能力。
  論文第四章通過(guò)分子動(dòng)力學(xué)模擬ACE抑制三肽IIP在水溶液和DMSO溶液中的構(gòu)象變化情況,來(lái)研究IIP分子具有ACE抑制活性和失活兩種不同情況下的構(gòu)象差異。結(jié)果表明IIP分子在兩種溶液中均主要以伸展構(gòu)象存在,而在水溶液中更為伸展;IIP分子在水溶液中具有良好的柔順性,能夠在折疊構(gòu)象和伸展構(gòu)象之間快速地轉(zhuǎn)換,在DMS

5、O溶液中柔順性則要差得多。比較IIP分子在水溶液和DMSO溶液中的核磁共振二維NOESY譜得到與分子動(dòng)力學(xué)模擬相一致的結(jié)論。
  論文第五章采用分子對(duì)接與分子動(dòng)力學(xué)模擬的方法研究了IIP分子與ACE結(jié)合的作用機(jī)制。研究發(fā)現(xiàn)IIP分子中脯氨酸的吡咯環(huán)與ACE活性口袋中的疏水區(qū)域的緊密結(jié)合,以及IIP分子中第三位脯氨酸與ACE分子中的Lys-475殘基的強(qiáng)氫鍵是IIP與ACE結(jié)合主要能量。而在IIP分子中第三位脯氨酸殘基最有利于ACE

6、與IIP的結(jié)合,其次為第一位異亮氨酸殘基,最后為第二位異亮氨酸殘基。配體IIP中這三氨基酸殘基的對(duì)結(jié)合能貢獻(xiàn)的順序說(shuō)明ACE抑制三肽的第一位和第三位對(duì)抑制活性的影響較大,中間的對(duì)抑制活性的影響較小,這與定量構(gòu)效關(guān)系研究的結(jié)論相一致。
  本論文將理論和實(shí)驗(yàn)相結(jié)合,建立了一套包含模型的建立、活性的預(yù)測(cè)、高活性肽的篩選,活性肽的合成,活性的檢測(cè),模型準(zhǔn)確性的驗(yàn)證,并對(duì)活性分子結(jié)構(gòu)和活性給出微觀解釋的系統(tǒng)方法。對(duì)研究ACE抑制肽具有一定

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