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文檔簡介
1、SPSB蛋白家族由四個(gè)高度保守的成員(SPSB1-SPSB4)組成,共同特征是其氨基酸包含SPRY結(jié)構(gòu)域和羧基(C)端的SOCS-box基序。雖然在高等動(dòng)物和一些無脊椎動(dòng)物中已克隆了Spsb基因并對其表達(dá)模式進(jìn)行了分析,但是,到目前為止,這些基因確切的功能尚不清楚。本研究以日本三角渦蟲(Dugesia japonica)為實(shí)驗(yàn)材料,克隆了DjSpsb基因的全長cDNA序列并對其表達(dá)模式進(jìn)行了系統(tǒng)分析,結(jié)果如下:
1、利用RAC
2、E技術(shù)首次在日本三角渦蟲中克隆了Spsb基因的全長cDNA序列。DjSpsb基因的cDNA全長為1251 bp,包含一個(gè)105 bp的5'端非翻譯區(qū)(5'UTR)和一個(gè)87 bp的3'端非翻譯區(qū)(3'UTR)。其中3'端非翻譯區(qū)包含一個(gè)poly(A)尾和一個(gè)終止密碼子。最大開放閱讀框(ORF)為1059 bp,編碼一個(gè)由352個(gè)氨基酸殘基組成的蛋白質(zhì)。
2、利用ExPASy,TMHMM2.0、SMART、InterPro等其他
3、在線軟件對該基因所推導(dǎo)的氨基酸序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析,結(jié)果表明:DjSPSB蛋白的分子量為40.90 kDa,理論等電點(diǎn)為9.04,含有一個(gè)保守的SPRY結(jié)構(gòu)域和一個(gè)SOCS盒,為親水性核蛋白,存在多個(gè)磷酸化位點(diǎn),無信號肽且不存在跨膜區(qū)。
3、根據(jù)該基因所推導(dǎo)的氨基酸序列利用用貝葉斯MrBayes3.1.2構(gòu)建了系統(tǒng)發(fā)育樹。系統(tǒng)進(jìn)化分析表明DjSpsb在多細(xì)胞動(dòng)物進(jìn)化過程中高度保守,且與Spsb1,Spsb2和Spsb4有較高
4、的同源性。
4、利用整體原位雜交、切片原位雜交和實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)研究了DjSpsb基因在整體及再生渦蟲中的時(shí)空表達(dá)模式。結(jié)果表明:在性未成熟的整體渦蟲中,DjSpsb主要在頭部表達(dá)且邊緣部位陽性信號較強(qiáng),此外,DjSpsb在神經(jīng)組織和腸支表達(dá);在性成熟的個(gè)體中,陽性信號主要在頭部、睪丸和卵黃腺部位表達(dá),卵巢部位不表達(dá);在再生個(gè)體中,陽性信號在再生胚基表達(dá)。RT-PCR結(jié)果顯示,在尾再生頭部分,DjSpsb基因在切割后1,
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