福瑞鯉8個(gè)家系的TRAP分析.pdf

1、福瑞鯉(FFRC strain common carp，Cyprinus carpio)是近幾年經(jīng)人工培育獲得的鯉魚(yú)新品種，因具有體型好、生長(zhǎng)速度快、飼料轉(zhuǎn)化率高、適應(yīng)能力強(qiáng)、耐性好以及遺傳穩(wěn)定等優(yōu)點(diǎn)而深受廣大養(yǎng)殖者的喜愛(ài)，推廣面積不斷擴(kuò)大，在主要淡水養(yǎng)殖魚(yú)類中的地位也越來(lái)越重要。作為一種鯉魚(yú)新品種，需要不斷地對(duì)其進(jìn)行遺傳保護(hù)和選育保種，并在原有的基礎(chǔ)上通過(guò)遺傳改良使該品種得到新的提高。靶位區(qū)域擴(kuò)增多態(tài)性(target region a

2、mplified polymorphism，TRAP)是由Hu等提出來(lái)的一種新型分子標(biāo)記技術(shù)，通過(guò)在大量農(nóng)作物上的應(yīng)用發(fā)現(xiàn)TRAP具有簡(jiǎn)單、高效、重復(fù)性好、易測(cè)序等優(yōu)點(diǎn)，故TRAP自開(kāi)發(fā)以來(lái)得到了廣泛的關(guān)注。本研究分別從表型水平和分子水平上對(duì)8個(gè)福瑞鯉家系進(jìn)行分析，為福瑞鯉選育保種和遺傳改良工作提供了形態(tài)學(xué)和遺傳學(xué)方面的依據(jù)。同時(shí)，進(jìn)一步篩選跟福瑞鯉生長(zhǎng)相關(guān)的TRAP標(biāo)記，為開(kāi)發(fā)和利用福瑞鯉分子標(biāo)記輔助育種奠定了一定的理論基礎(chǔ)。

3、　　首先，利用相關(guān)分析、通徑分析和多元回歸分析方法對(duì)福瑞鯉生長(zhǎng)速度差異群體不同養(yǎng)殖時(shí)間的體型性狀進(jìn)行分析。相關(guān)性分析表明:80天時(shí)，與體質(zhì)量相關(guān)性最大的形態(tài)性狀在生長(zhǎng)速度慢的家系傾向于是體高而在生長(zhǎng)速度快的家系中則是體厚;234天時(shí)，各家系形態(tài)性狀與體質(zhì)量的相關(guān)性趨于一致，均為體長(zhǎng)＞體高＞體厚。8個(gè)家系不同日齡形態(tài)性狀的通徑分析結(jié)果顯示，體長(zhǎng)、體厚以及體高對(duì)體質(zhì)量的直接作用均達(dá)到了極顯著的水平。80天時(shí)，生長(zhǎng)速度慢家系對(duì)體質(zhì)量的直接作用

4、最大的是體長(zhǎng)而生長(zhǎng)速度快的家系為體厚;234天時(shí)，8個(gè)家系對(duì)體質(zhì)量直接作用最大的均為體長(zhǎng)。對(duì)不同日齡的各家系進(jìn)行回歸分析表明，各家系在不同日齡的相關(guān)指數(shù)R2均大于0.85，回歸關(guān)系均達(dá)到了極顯著水平(P＜0.01)，說(shuō)明在福瑞鯉中體長(zhǎng)、體厚、體高均是影響體質(zhì)量的主要性狀。
　　在分子水平上，利用TRAP分子標(biāo)記對(duì)生長(zhǎng)速度差異(4個(gè)生長(zhǎng)速度快，4個(gè)生長(zhǎng)速度慢)的家系進(jìn)行了遺傳多樣性分析。結(jié)果顯示:8個(gè)家系的多態(tài)性條帶在9.41～12

5、.00之間，多態(tài)性比率范圍為52.04％～66.02％，多態(tài)信息含量為0.19～0.24，Nei遺傳多樣指數(shù)和Shannon信息指數(shù)分別介于0.19～0.24和0.28～0.35之間，其中家系85＃的各遺傳參數(shù)值最高，而家系74＃的最低，且生長(zhǎng)速度慢的四個(gè)家系51＃、56＃、74＃、85＃遺傳多樣性參數(shù)的均值與生長(zhǎng)速度快的四個(gè)家系26＃、35＃、89＃、92＃的均值之間并沒(méi)有明顯差異。家系間的遺傳分化指數(shù)（Fst）及分子變異方差(AMO

6、VA)分析顯示，除了家系56＃與92＃(Fst=0.0516)及51＃與89＃(Fst=0.0956)這2對(duì)家系間處于中等程度的遺傳分化(0.05≤Fst≤0.15)之外，其他家系間遺傳分化水平均較低（Fst＜0.05），群體的總遺傳變異主要來(lái)源于家系內(nèi)個(gè)體間的遺傳差異，其方差分量的貢獻(xiàn)率達(dá)98.3％。遺傳距離分析結(jié)果表明，家系26＃與92＃的遺傳距離最大，家系85＃與89＃的遺傳距離最小;基于此的UPGMA聚類分析顯示，56＃家系與7

7、4＃家系以及85＃家系與89＃家系的親緣關(guān)系比較近，聚類在同一分支上，而其他家系親緣關(guān)系相對(duì)較遠(yuǎn)。研究表明8個(gè)福瑞鯉家系內(nèi)遺傳變異較大，遺傳多樣性水平較高，具有一定的育種潛力，可擴(kuò)大福瑞鯉的選育空間。
　　最后，對(duì)福瑞鯉跟生長(zhǎng)性狀相關(guān)的TRAP分子標(biāo)記進(jìn)行關(guān)聯(lián)性分析，在生長(zhǎng)速度慢的群體當(dāng)中發(fā)現(xiàn)引物組合IGF2a-1-Trap13-240、IGF2a-1-odd26-750與體重、體長(zhǎng)和體高都相關(guān);在生長(zhǎng)速度快的群體當(dāng)中除了IGF2