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文檔簡介
1、實(shí)驗(yàn)研究表明:三核鉑BBR3464是一類比順鉑具有更強(qiáng)細(xì)胞毒性的非經(jīng)典鉑類金屬抗癌藥物,尤其是針對(duì)那些對(duì)順鉑已產(chǎn)生耐藥性的癌細(xì)胞。DNA被認(rèn)為是順鉑的主要生物靶分子,在體內(nèi)還存在很多的生物分子包括谷胱甘肽、半胱氨酸在體內(nèi)的濃度將近10mM左右。因此,有研究觀點(diǎn)認(rèn)為鉑類藥物的抗癌活性也與各種生物小分子的反應(yīng)有關(guān)系,然而具體的作用機(jī)理還不是很清楚。因此,在本論文中,我們通過采用密度泛函理論(DFT)和等電聚焦連續(xù)極化(IEF-PCM)溶劑化
2、模型對(duì)多核鉑(BBR3005和BBR3464)與生物靶分子(谷胱甘肽、半胱氨酸、蛋氨酸、DNA嘌呤堿基)的作用機(jī)理進(jìn)行了理論研究。
在第三章中,我們研究了順鉑、雙核鉑BBR3005以及三核鉑BBR3464的一水和二水解配合物與DNA嘌呤堿基和谷胱甘肽、半胱氨酸、蛋氨酸上S位點(diǎn)的單功能取代反應(yīng)。計(jì)算結(jié)果表明:BBR3464的抗癌活性強(qiáng)于順鉑;另外,通過使用B3LYP以及M06方法計(jì)算所得的結(jié)果表明,在水溶液中,BBR3464與谷
3、胱甘肽反應(yīng)的活化自由能低于與半胱氨酸、蛋氨酸、以及DNA嘌呤堿基反應(yīng)的活化自由能,這說明在動(dòng)力學(xué)上谷胱甘肽是BBR3464更優(yōu)的生物靶分子。我們通過B3LYP方法計(jì)算得到的順鉑與鳥嘌呤反應(yīng)的活化自由能(20.1 kcal/mol)很接近實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù)(18.3 kcal/mol),而通過M06方法計(jì)算的活化自由能是11.2 kcal/mol,表明B3LYP比M06泛函方法更適合于Pt-DNA體系的計(jì)算。
在第四章中,我們主要在第三
4、章研究結(jié)果的基礎(chǔ)上,研究了雙核鉑BBR3005和三核鉑BBR3464與靶分子谷胱甘肽、半胱氨酸、蛋氨酸以及DNA嘌呤堿基的雙功能取代反應(yīng)。研究結(jié)果表明:在水溶液中,雙核鉑BBR3005的雙功能取代反應(yīng)的活性順序?yàn)椋篏-GSH>GG>GA。多核鉑與DNA嘌呤堿基的雙功能取代反應(yīng)的相對(duì)活化自由能仍低于順鉑相應(yīng)雙功能取代反應(yīng)的活化能。另外,計(jì)算結(jié)果發(fā)現(xiàn)多核鉑與DNA的頭碰頭(HH)交聯(lián)會(huì)轉(zhuǎn)化為頭碰尾(HT)交聯(lián)方式,而且計(jì)算的頭碰頭(HH)和
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