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1、非生物逆境是作物產(chǎn)量的主要制約因素?,F(xiàn)代分子生物學(xué)手段現(xiàn)已廣泛應(yīng)用于育種研究,并獲得不少具有優(yōu)良耐逆能力的作物新品種。類鈣調(diào)磷酸酶B亞基蛋白(calcineurin B-like proteins,CBL)是一類重要的鈣信號(hào)受體蛋白,在非生物脅迫應(yīng)答反應(yīng)中具有重要作用,主要通過與CBL相互作用蛋白激酶(CBL-interacting protein kinases,CIPK)相互作用將信號(hào)向下游傳遞。擬南芥中CBL和CIPK家族成員在耐
2、逆中的作用已有較深入的研究,其中AtSOS3(CBL4)和AtCIPK24(SOS2)是SOS途徑的兩個(gè)關(guān)鍵組分,在植物鹽脅迫應(yīng)答中發(fā)揮重要作用。但是小麥中CBL和CIPK家族成員功能以及是否存在SOS途徑還不清楚,SOS途徑在植物中是否具有保守性和通用性還未見報(bào)道。
本研究基于以上科學(xué)問題,利用生物信息學(xué)方法系統(tǒng)分析了小麥CBL和CIPK基因家族,從本室培育的小麥漸滲系耐鹽品種山融3號(hào)(SR3)中克隆了一系列TaCBLs
3、和TaCIPKs基因,并初步驗(yàn)證了TaCBL4、TaCBL3在非生物脅迫應(yīng)答中的功能。
一、小麥CBL和CIPK的生物信息學(xué)分析和新基因克隆
通過生物信息學(xué)分析,電子克隆了14個(gè)小麥CBL家族成員和34個(gè)小麥CIPK家族成員。多序列比對(duì)及進(jìn)化樹分析顯示,這些TaCBLs在大小和結(jié)構(gòu)上非常保守,其中5個(gè)具有豆蔻?;稽c(diǎn),2個(gè)具有跨膜疏水區(qū),暗示這7個(gè)TaCBLs在抗逆中發(fā)揮重要作用。TaCIPKs間序列差異比較
4、大,但結(jié)構(gòu)十分保守。SR3中TaCIPKs間也存在差異,這可能與基因倍增過程相關(guān)。進(jìn)化樹分析顯示,小麥中TaCBLs和TaCIPKs都存在許多旁系同源基因,并且它們與水稻中同源基因的相似性高于擬南芥。
將這些電子克隆的TaCIPK基因與實(shí)驗(yàn)室定制的小麥cDNA芯片探針進(jìn)行比對(duì),以分析它們的鹽脅迫應(yīng)答特征。結(jié)果發(fā)現(xiàn),8個(gè)TaCIPKs在芯片中有特異性匹配探針,其中4個(gè)為鹽誘導(dǎo)表達(dá)基因,4個(gè)鹽下調(diào)表達(dá)基因;另外,芯片中有3個(gè)探
5、針分別對(duì)應(yīng)多個(gè)TaCIPK序列,而且這3個(gè)探針在鹽脅迫24 h后表達(dá)量都顯著提高。這些鹽脅迫應(yīng)答的TaCIPKs可能都參與植物的鹽脅迫應(yīng)答反應(yīng),其功能需要進(jìn)一步研究。
根據(jù)電子克隆序列,從SR3中克隆3個(gè)TaCBL和9個(gè)TaCIPK新基因,按照與擬南芥 CBLs的同源性,分別命名為 TaCBL1/3/4和TaCIPK2/8/11/15/17/19/30/32/34。TaCIPKs中,TaCIPK8、TaCIPK15在鹽脅迫
6、下上調(diào)表達(dá),TaCIPK11下調(diào)表達(dá),其他基因的應(yīng)答模式有待進(jìn)一步驗(yàn)證,為耐鹽候選基因的鑒定及TaCBL互作蛋白的篩選奠定了基礎(chǔ)。
二、小麥TaCBL4和TaCBL3功能分析
1、 TaCBL4結(jié)構(gòu)與可能作用分析
TaCBL4有7個(gè)內(nèi)含子,其編碼產(chǎn)物定位于細(xì)胞膜,與擬南芥同源基因AtSOS3(CBL4)相似,是AtSOS3同源基因。TaCBL4在小麥的根、葉、莖、幼穗、麥芒、幼胚、旗葉等組織中均
7、能表達(dá),NaCl脅迫下其表達(dá)量明顯增加,表明TaCBL4在小麥生長(zhǎng)發(fā)育和鹽脅迫應(yīng)答過程中均發(fā)揮重要作用。
為了驗(yàn)證TaCBL4的生物學(xué)功能及其與AtSOS3的異同,將其在擬南芥Col-0野生型和sos3突變體中異源表達(dá),觀察表型變化,并用AtSOS3在擬南芥中的過表達(dá)系作為對(duì)照。TaCBL4過表達(dá)不影響擬南芥的營(yíng)養(yǎng)和生殖生長(zhǎng)。在1/2 MS培養(yǎng)基中,Col-0(WT)、TaCBL4過表達(dá)野生型系(OE)、TaCBL4過表達(dá)
8、sos3(sOE)幼苗根長(zhǎng)和地上部分無顯著性差異。NaCl脅迫下,與WT相比,sos3幼苗的主根更短、地上部分漂白程度高,與朱建康實(shí)驗(yàn)室結(jié)果一致;而OE系和sOE系幼苗根與WT沒有顯著差別,但是葉片顯著變小。這顯示,TaCBL4能夠恢復(fù)sos3根的表型,但首次發(fā)現(xiàn)OE系和sOE系在脅迫下抑制葉生長(zhǎng)。LiCl脅迫下,與WT相比,sos3幼苗的主根明顯變短、地上部分變小,而OE系、sOE系及AtSOS3過表達(dá)系幼苗正好相反,主根更長(zhǎng)、地上部
9、分更大,首次表明TaCBL4和AtSOS3過表達(dá)可以提高幼苗期鋰離子脅迫抗性。在ABA處理和滲透脅迫下,不同株系無明顯差異,表明TaCBL4是一個(gè)離子特異性響應(yīng)基因。
相比植株發(fā)育,鹽脅迫對(duì)種子萌發(fā)的影響更大。為了分析TaCBL4在這一階段是否發(fā)揮重要作用,我們以綠色子葉張開率為標(biāo)準(zhǔn),比較了不同株系在鈉、鋰離子脅迫下的萌發(fā)率差異。NaCl脅迫下,sos3不萌發(fā),WT萌發(fā)率降低,而OE系和sOE萌發(fā)率受影響少,萌發(fā)率明顯比W
10、T高。LiCl處理下,WT和sos3的萌發(fā)率降低,其中sos3降低更明顯,而OE系和sOE萌發(fā)率無顯著變化。
高鹽土壤一般堿性較高,我們發(fā)現(xiàn)與WT相比,OE系在鹽堿條件下的萌發(fā)率明顯提高。
以上結(jié)果顯示,TaCBL4和AtSOS3一樣,也是鈉、鋰離子特異性響應(yīng)基因,并且TaCBL4和AtSOS3在鹽脅迫應(yīng)答中發(fā)揮相似的功能,表明小麥中也存在SOS系統(tǒng),而且不同植物間SOS系統(tǒng)存在保守性和通用性。本實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),T
11、aCBL4在小麥抗鈉離子育種中應(yīng)該有針對(duì)性地設(shè)計(jì)在種子萌發(fā)階段特異性表達(dá),而在抗鋰離子育種中則不受此限制。
有趣的是,低鉀條件下,與Col-0相比,OE系和sOE系幼苗的地上部分明顯變小,而AtSOS3過表達(dá)系則無顯著變化,推測(cè)TaCBL4可能還調(diào)控鉀離子通道的活性。這一結(jié)果表明,TaCBL4在鹽脅迫應(yīng)答中的作用與鉀相關(guān),幼苗階段TaCBL4降低對(duì)Na+的耐性是由于負(fù)調(diào)控K+的轉(zhuǎn)運(yùn)引起的,顯示了不同物種間SOS系統(tǒng)的特異性
12、。
為了進(jìn)一步認(rèn)識(shí)TaCBL4的作用機(jī)制及其與AtSOS3功能的異同,我們利用酵母雙雜交方法分離擬南芥中與TaCBL4相互作用的CIPK蛋白。結(jié)果發(fā)現(xiàn),TaCBL4能與AtCIPK5/10/11/15/18/21/24這7個(gè)CIPKs互作,其中AtCIPK15/24為AtSOS3互作蛋白,而AtCIPK6/7不與TaCBL4互作。推測(cè)TaCBL4通過與AtCIPK11相互作用而抑制了后者活性,提高了植株的抗鹽堿性,通過At
13、CIPK24(SOS2)互作而激活SOS通路促進(jìn)Na+外排。TaCBL4和AtSOS3互作CIPKs種類存在相似性和特異性,而且TaCBL4和AtSOS3對(duì)與其共同互作的CIPKs的調(diào)控也可能存在差異性,那么這種特異性和差異性是否與TaCBL4過表達(dá)導(dǎo)致的低鉀敏感型相關(guān),需要進(jìn)一步研究。
2、 TaCBL3功能的初步分析
TaCBL3與水稻OsCBL6及擬南芥AtCBL2、AtCBL6相似性較高,其編碼蛋白定
14、位于液泡膜。離子和滲透脅迫下,TaCBL3過表達(dá)擬南芥株系與Col-0無明顯差異。缺鉀誘導(dǎo)TaCBL3的表達(dá),而且缺鉀條件下,與Col-0相比,TaCBL3過表達(dá)株系黃化更嚴(yán)重,植株生長(zhǎng)抑制程度更顯著。這表明,TaCB(L)3可能是鉀離子通道的抑制因子,為植物離子轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制研究提供了新的基因資源。
總之,本論文通過生物信息學(xué)和分子生物學(xué)方法,系統(tǒng)分析了小麥CBL和CIPK家族成員的序列和表達(dá)特征,通過CBL4的功能分析明確了
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