氣相賴氨酸和賴氨酸與H-,2-O復合體的穩(wěn)定構型及性質的理論研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本論文共4章,分為三部分,第一部分(第一章)是關于本論文使用的一些基本理論和計算方法介紹,第二部分包括二章(第二章和第三章),主要是關于氣相賴氨酸和賴氨酸與一個水分子復合后的構型和性質研究,第三部分(第四章)是對所做的工作做一下總結,具體內容如下: 第一章,主要對本論文使用的一些計算方法和基本理論進行了簡單的介紹。首先回顧了量子化學的發(fā)展,介紹了Hartree-Fock理論,接著介紹了本論文所使用到的計算方法,從頭計算法和半經(jīng)驗

2、方法。隨后介紹了量子化學的另外幾個基本原理,包括電子相互作用、組態(tài)相互作用理論、耦合簇方法、微擾理論、密度泛函理論和含時密度泛函理論;最后,介紹了幾種溶劑化模型。 第二章,首先簡單介紹了組成蛋白質基本結構的20種氨基酸。然后詳細討論了我們尋找賴氨酸低能量構型所使用的具體方法,給出了我們利用半經(jīng)驗方法、從頭算方法和密度泛函理論方法得到的氣相規(guī)范性、質子化和去質子化賴氨酸較穩(wěn)定的互變異構體的結構和能量,以及它們的一系列物理化學性質,

3、包括相對能、零點振動能、轉動常數(shù)、偶極矩、簡諧振動頻率、垂直電離能、質子親和勢、質子解離能、氣相酸性、氣相堿性、焓僮、吉布斯自由能以及在不同溫度下的構型分布。 第三章,詳細討論了我們尋找氣相中賴氨酸與一個水分子復合體的低能量構型所使用的具體方法,給出了尋找到的規(guī)范性和雙電性構型及相關物理量。并把目光轉向更接近于賴氨酸真實存在環(huán)境的水溶液中來研究賴氨酸的結構性質。我們應用CPCM溶劑化模型研究賴氨酸在溶液中的能量,驗證了規(guī)范性構型

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