若干氨基酸分子構(gòu)象與電離能的理論研究.pdf

1、氨基酸是生物功能大分子蛋白質(zhì)的基本組成單位，是構(gòu)成人體營(yíng)養(yǎng)所需蛋白質(zhì)的基本物質(zhì)。氨基酸單體分子的物理化學(xué)性質(zhì)的研究對(duì)復(fù)雜生物體系統(tǒng)動(dòng)力學(xué)過(guò)程的認(rèn)識(shí)極其關(guān)鍵。
　　本文在Gaussian09程序中以量子化學(xué)的密度泛函理論(DFT)和M062X方法為主要計(jì)算方法，對(duì)苯基丙氨酸和氨基丁酸分子(GABA)進(jìn)行全勢(shì)能面掃描，尋找它們所有可能存在的穩(wěn)定構(gòu)象。氨基酸分子具有較多的轉(zhuǎn)動(dòng)自由度，氣象單體分子存在較多的局域穩(wěn)定構(gòu)象，這些構(gòu)象的穩(wěn)定性與

2、通過(guò)轉(zhuǎn)動(dòng)形成的分子內(nèi)氫鍵以及分子內(nèi)超共軛相互作用緊密相關(guān)。在文章中，我們針對(duì)苯基丙氨酸和氨基丁酸分子的穩(wěn)定構(gòu)型，用電子密度拓?fù)浞治龇ㄒ约白匀绘I軌道理論研究了分子內(nèi)相互作用并給出定量和定性的描述。此外，我們也分析了分子內(nèi)氫鍵和分子內(nèi)超共軛相互作用對(duì)分子穩(wěn)定性的影響。分子的光電子能譜提供了分子軌道的直接測(cè)定和分子中電子結(jié)構(gòu)的的信息。論文中我們應(yīng)用電子傳播子理論的P3近似方法(partialthird-orderquasiparticalap

3、proximation)理論計(jì)算了這些氨基酸分子的垂直電離能，對(duì)實(shí)驗(yàn)上得到的光電子能譜進(jìn)行了標(biāo)識(shí)，并理論模擬了光電子能譜，兩者都與實(shí)驗(yàn)符合的很好。
　　本文主要有四章內(nèi)容，第一章介紹了氨基酸分子的國(guó)內(nèi)外研究現(xiàn)狀，研究的主要理論和方法，第二章詳細(xì)介紹了量子化學(xué)的理論知識(shí)，電子相關(guān)，密度泛函理論，P3近似方法等。第三章研究了苯基丙氨酸分子的穩(wěn)定構(gòu)象，以及苯基丙氨酸分子的分子內(nèi)氫鍵。第四章中我們對(duì)氨基丁酸分子的穩(wěn)定構(gòu)象，分子內(nèi)相互作用以