淺談如何閱讀文獻(xiàn)

1、淺談如何閱讀文獻(xiàn)------書山有路,徐 輝2009-3-5,2,內(nèi)容提要,閱讀文獻(xiàn)入門方法帶著問題閱讀文獻(xiàn)Idea如何產(chǎn)生小結(jié),3,1. 文獻(xiàn)的意義,為什么要閱讀文獻(xiàn)？,文獻(xiàn)是知識(shí)庫（科學(xué)知識(shí)結(jié)晶）文獻(xiàn)是“巨人的肩膀”（前輩研究成果）,科學(xué)研究是知識(shí)不斷積累的過程 任何理論都不是憑空想象出來的,4,2. 閱讀文獻(xiàn)的方法,分階段，不同階段重點(diǎn)不同 帶著問題看文獻(xiàn)（目的性） 善于記錄總結(jié) 善于提問、善于思

2、考,5,初級(jí)階段：入門中級(jí)階段：開題高級(jí)階段：課題開展、論文撰寫,文獻(xiàn)閱讀者可分為三個(gè)階段：,分階段,6,入門：掌握某領(lǐng)域的起源、重要里程碑， 了解最新進(jìn)展。開題：由面到點(diǎn)，深入到你感興趣的問題。課題開展、論文撰寫：針對(duì)某一問題，做到 如數(shù)家珍。,所處不同階段重點(diǎn)不同：,分階段,7,入門階段,泛讀某個(gè)大領(lǐng)域的三五篇綜述 ? 選擇你所感興趣的小領(lǐng)域

3、精讀十篇經(jīng)典文獻(xiàn) ? 掌握某領(lǐng)域的研究歷史和成果泛讀十篇近兩年內(nèi)NCS上的相關(guān)文章 ? 了解某領(lǐng)域的最新進(jìn)展,總體閱讀方法：泛讀?精讀?泛讀,分階段,8,結(jié)構(gòu)功能調(diào)控,,rRNAtRNAmRNA… …snoRNAmiRNA… …,DNARNAProtein,分子生物學(xué),,,1. 泛讀某個(gè)大領(lǐng)域的三五篇綜述 ? 選擇你所感興趣的小領(lǐng)域,分階段,Example：,9,

4、2. 精讀幾篇經(jīng)典文獻(xiàn),秘笈1：求精不求多秘笈2：忌喜新厭舊,精讀2~3篇經(jīng)典Review，逐字逐句吃透它，大致了解整個(gè)領(lǐng)域。精讀5~8篇里程碑級(jí)Article，掌握這個(gè)領(lǐng)域涉及的主要方面、研究?jī)?nèi)容、研究方法、結(jié)果和意義。,經(jīng)典文獻(xiàn)哪里找？NPG和Cell Press 的Review和Article；經(jīng)典Review里引用的文獻(xiàn)。,分階段,10,3. 泛讀，全面了解,泛讀10篇兩年內(nèi)最新Article，了解目前進(jìn)展。當(dāng)你了解了

5、一個(gè)領(lǐng)域的歷史后，必須了解它的現(xiàn)在和未來。 ? 開題階段,分階段,11,開題階段,開題：好的idea如何產(chǎn)生？,任何理論都不是憑空想象出來的 Idea來源于讀文獻(xiàn)時(shí)產(chǎn)生的靈感,分階段,12,帶著問題看文獻(xiàn)------最高秘笈,沒有目的不要看文獻(xiàn) （今天我想知道什么？） 有的放矢------就像做英語閱讀理解題， 不要浪費(fèi)時(shí)間在無關(guān)的信息上。 得到

6、滿意的答案才是完成工作。,目的性,,13,我想知道：“microRNA是什么？”把問題拆分，由大化小，由少化多。,目的性,Example：,microRNA是RNA，那么它是什么樣的RNA？有很多嗎？分子大小如何？分布廣泛?jiǎn)?？有什么結(jié)構(gòu)特點(diǎn)？為什么命名為這個(gè)名字？有什么功能？…,14,帶著這些問題，看幾篇綜述，然后作答：,目的性,microRNA是一類高等真核生物體內(nèi)普遍表達(dá)的長(zhǎng)度在22個(gè)核苷酸左右的單鏈小分子RNA，它以堿基互補(bǔ)的原

7、則作用于mRNA的3’UTR，在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)節(jié)基因的表達(dá)。以上定義中包含我找出的12個(gè)必要信息。,15,Article 本身也是由問題和其相對(duì)的答案組成（發(fā)現(xiàn)了某種現(xiàn)象，提出什么問題，如何解決，得到了什么結(jié)果，結(jié)果如何，有何意義）。針對(duì)某一篇文獻(xiàn)，按照科學(xué)研究的內(nèi)在邏輯順序去逐層解讀文獻(xiàn)，更易于理解和掌握。 “現(xiàn)象?提出問題? 解決問題”Cell中的paper堪稱科研論文的典范。它的表述順序和格式是最標(biāo)準(zhǔn)的邏輯語言。,目的

8、性,帶著問題看文獻(xiàn)的另一層含義,16,,,,,某種現(xiàn)象,提出問題,采取方法,結(jié)果與分析,Cell，2005,17,此處包含四層意思： 好記性不如爛筆頭，寫一遍勝過讀十遍 靈感往往瞬息而逝 總結(jié)是一種認(rèn)識(shí)的升華 溫故而知新,善于記錄總結(jié),18,如何總結(jié)？記錄什么？,記錄暫時(shí)不能得到答案的問題。標(biāo)記文章中你認(rèn)為重要的信息。標(biāo)記文章中的作者的推測(cè)和假想。記錄靈感的火花。記錄你的讀后感。自己寫摘要（以你的角度評(píng)

9、述文章）。時(shí)常整理你的備忘錄。,善于記錄總結(jié),,,19,開題階段,開題：好的idea如何產(chǎn)生？,任何理論都不是憑空想象出來的 Idea來源于讀文獻(xiàn)時(shí)產(chǎn)生的靈感,善于思考,20,idea源于對(duì)問題的思考,在文獻(xiàn)閱讀時(shí)，只要你勤于思考，斟字酌句時(shí)便會(huì)產(chǎn)生很多問題，這些問題自然地幫助你產(chǎn)生許多idea.,善于思考,microRNA是一類高等真核生物體內(nèi)普遍表達(dá)的長(zhǎng)度在22個(gè)核苷酸左右的單鏈小分子RNA，它以堿基互補(bǔ)的原則作用于mRNA

10、的3’UTR，在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)節(jié)基因的表達(dá)。,Example：,21,一類：如何歸類，分類標(biāo)準(zhǔn)是什么？到底有多少個(gè)？占基因組多少比例？這么多有什么意義？目前全部發(fā)現(xiàn)了嗎？高等真核生物：最原始的具有miRNA的生物是什么？ miRNA的進(jìn)化始于什么年代？為什么原核生物沒有？普遍表達(dá)：每時(shí)每刻都表達(dá)，還是有時(shí)序性？有沒有特異表達(dá)的？種屬特異，組織特異，細(xì)胞特異，時(shí)期特異？22個(gè)核苷酸左右：這個(gè)長(zhǎng)度是如何產(chǎn)生的？這個(gè)長(zhǎng)度有什么意義？必需在

11、這個(gè)長(zhǎng)度嗎？單鏈：?jiǎn)捂湹挠袥]有二級(jí)結(jié)構(gòu)？單鏈RNA穩(wěn)定性不高，這是否與miRNA發(fā)揮其功能的方式有關(guān)？單鏈的RNA都有蛋白保護(hù)，miRNA的保護(hù)蛋白是什么？,善于思考,22,一篇文獻(xiàn)為什么能發(fā)nature？它的閃亮點(diǎn)是什么？作者如何想到這個(gè)idea？他的工作無懈可擊嗎？將來他們會(huì)沿著這條思路做下去嗎？有什么他們尚未涉足的領(lǐng)域嗎？,善于思考,思考才能提高自己,認(rèn)識(shí)水平的提高 視覺角度的提高 科學(xué)問題出發(fā)點(diǎn)的提高 走在世界最前