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文檔簡介
1、瓊脂糖凝膠電泳檢測瓊脂糖凝膠電泳檢測RNARNA質量質量二材料與方法1材料RNA樣品2儀器、用具電泳儀、電泳槽、凝膠樣品梳、微波爐、移液器等3試劑(1)1TAE電泳緩沖液(2)溴化乙錠溶液(EB)[有毒,小心操作](3)瓊脂糖(4)6加樣緩沖液4方法(1)選擇孔徑大小適合的點樣梳,垂直架在膠版的一端,使點樣梳底部離電泳槽水平面的距離為0.51mm。(2)稱取0.25g瓊脂糖,加入25ml1TAE電泳緩沖液中,微波爐加熱使瓊脂糖溶解均勻。
2、(3)于50ml的離心管中加入1.25μlEB(10mgml)。(4)待凝膠冷卻至50℃左右,將凝膠倒入50ml離心管中。(5)將離心管中的凝膠溶液輕輕倒入電泳凝膠板上,除去氣泡。(6)待凝膠凝固后,小心取出點樣梳。(7)在電泳槽中加入1TAE電泳緩沖液,將膠板放入電泳槽中(點樣孔一端靠近電泳槽的負極),使電泳緩沖液沒過膠面。(8)待測樣品中加入16體積的6上樣緩沖液,混合后,移液槍點樣,記錄樣品點樣順序及樣量。(9)連接電泳槽與電泳儀
3、之間的電源線,正極為紅色,負極為黑色。(10)開啟電源,開始電泳,最高電壓不超過5Vcm。(11)當指示劑跑過膠板的23,可終止電泳;切斷電源后,將電泳凝膠塊放在凝膠成像儀中觀察,拍照。電泳檢測:電泳檢測:1%瓊脂糖凝膠電泳,檢測RNA完整性,觀察18s、28s條帶。這里,RNA電泳要特別注意膠的濃度和質量。首先,濃度不宜過高,1%1.2%為宜。其次,每次配膠不宜過多,最好現(xiàn)用現(xiàn)配,但是一次配100ml,35次可用完也可。溶膠時一定要溶
4、解徹底并且均勻,否則倒膠時產生氣泡,影響電泳效果。晾膠時,要以稍高于體溫為佳,溫度過高會導致膠體過軟,給點樣造成困難。倒膠時,注意膠的厚度,原則是寧厚勿薄,膠板過薄點樣孔盛放不下點樣量,樣品溢出導致彌散。膠板如果很厚,一般要晾置20分鐘以上,否則膠體晾置不徹底,拔掉梳子會破壞點樣孔,同時膠體密度也會變得不均一,影響電泳效果。對于RNA電泳,電泳液的要求也很高,最好每次都使用新的電泳液,因為RNA極易降解,所以不宜與其他電泳液混用。同時,
5、要注意電泳液的配制,為1TAE,如果電泳液配制有誤則會導致電壓不穩(wěn),或者電壓無法上升。最后,保證了電泳液和膠體質量以后,就可以進行點樣了。點樣時,要注意點樣量,以3μl為宜,與loadingbuffer混勻后要用移液槍將其完全吸取,完全點入點樣孔內,不要有溢出,同時點樣時力度不宜過大,否則會使槍頭捅漏膠板,樣品流入電泳液,導致電泳失敗。電泳條件,由于RNA自身易降解的特點,建議使用高電壓,短時間電泳方式,130140v電壓,1015分鐘
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