illumina 、454 、abi 測序儀比較

1、Illumina、454、ABI測序儀比較Illumina測序儀測序儀Illumina公司的新一代測序儀GenomeAnalyzer最早由Solexa公司研發(fā)，利用其專利核心技術(shù)“DNA簇”和“可逆性末端終結(jié)（reversibleterminat）”，實現(xiàn)自動化樣本制備及基因組數(shù)百萬個堿基大規(guī)模平行測序。Illumina公司于2007年花費6億美金的巨資收購了Solexa，就是為了促成GenomeAnalyzer的商品化。GenomeA

2、nalyzer作為新一代測序技術(shù)平臺，具有高準(zhǔn)確性，高通量，高靈敏度，和低運行成本等突出優(yōu)勢，可以同時完成傳統(tǒng)基因組學(xué)研究（測序和注釋）以及功能基因組學(xué)（基因表達及調(diào)控，基因功能，蛋白核酸相互作用）研究。GenomeAnalyzer自上市以來，已經(jīng)為千人基因組計劃立下了赫赫戰(zhàn)功。今年早期，荷蘭科學(xué)家利用它首次繪出女性的基因組圖譜。而就在前兩周，《Nature》雜志上一連出現(xiàn)三個人類基因組圖譜：炎黃一號第一個亞洲人圖譜；第一個癌癥病人圖譜

3、；第一個非洲人圖譜。它們?nèi)且蕾嘒enomeAnalyzer完成的。嘩，一下就來仨！這和第一個人類基因組圖譜的13年形成了多么鮮明的對照。根據(jù)去年底的數(shù)據(jù)，GenomeAnalyzer已售出約200臺，估計是市場占有率最廣的。前不久，華大基因再添置了12臺，準(zhǔn)備放在香港和深圳的實驗室，至此華大基因已經(jīng)有29臺GenomeAnalyzer。而著名的麻省理工學(xué)院和哈佛大學(xué)Broad研究院擁有47臺Illumina測序儀。眾多實驗室之所以選擇

4、Illumina，看中的無疑是GenomeAnalyzer的高性價比。上個月，Illumina將GenomeAnalyzerII升級到GenomeAnalyzerIIx，距年底實現(xiàn)單次運行獲得95GB數(shù)據(jù)的宏偉目標(biāo)又近了一步。GenomeAnalyzerIIx有兩個核心特征：其一是更大的試劑冷卻器，支持超過100個測序循環(huán)，進一步提升了系統(tǒng)的易用性和自動化；其二是全新的流動池支架，讓每輪運行所得的高質(zhì)量數(shù)據(jù)增加20%。依靠系統(tǒng)軟件和試劑

5、的改進，GenomeAnalyzerIIx4.數(shù)據(jù)分析數(shù)據(jù)分析自動讀取堿基，數(shù)據(jù)被轉(zhuǎn)移到自動分析通道進行二次分析。GenomeAnalyzer系統(tǒng)之所以如此暢銷，關(guān)鍵在于其技術(shù)上的優(yōu)勢。1.可擴展的超高通量可擴展的超高通量GenomeAnalyzer系統(tǒng)目前每次運行后可獲得超過20GB的高品質(zhì)過濾數(shù)據(jù)。這個技術(shù)的可擴展性保證了更高的數(shù)據(jù)密度和輸出，能用更少的經(jīng)費完成更復(fù)雜的項目。到今年底，通量還有望上升到95GB，相當(dāng)于人類基因組的30

6、倍覆蓋度。2.需要樣品量少需要樣品量少GenomeAnalyzer系統(tǒng)需要的樣品量低至100ng，能應(yīng)用在很多樣品有限的實驗（比如免疫沉淀、顯微切割等）中。這也是很多研究人員所考慮的因素。3.簡單、快速、自動化簡單、快速、自動化GenomeAnalyzer系統(tǒng)提供了最簡單和簡潔的工作流程。即使是最小的實驗室也能像大型基因組中心一樣進行大規(guī)模的實驗。制備樣品文庫可以在幾小時內(nèi)完成，一個星期內(nèi)就能得到高精確度的數(shù)據(jù)。ClusterStati