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1、三種熒光定量PCR檢測方法比較定量pcr:以參照物為標準,對PCR終產(chǎn)物進行分析或?qū)CR過程進行監(jiān)測,從而達到評估樣本中靶基因的拷貝數(shù),稱為定量PCR。定量PCR的可行性定量一般是在PCR擴增的指數(shù)期進行的。常見熒光定量PCR檢測方法可分為以下幾類:(1)SYBRGreenI檢測模式SYBRGreenI是一種能與雙鏈DNA結(jié)合發(fā)光的熒光染料。其與雙鏈DNA結(jié)合后,熒光大大增強。因此,SYBRGreenI的熒光信號強度與雙鏈DNA的數(shù)量
2、相關(guān),可以根據(jù)熒光信號檢測出PCR體系存在的雙鏈DNA數(shù)量。SYBRGreenI的最大吸收波長約為497nm,發(fā)射波長最大約為520nm。PCR擴增程序一般為94℃~55℃~72℃三步法,40個循環(huán)。SYBRGreenI的缺點:由于SYBRGreenI沒有特異性,不能識別特定的雙鏈,只要是雙鏈就會結(jié)合發(fā)光,對PCR反應中的非特異性擴增或引物二聚體也會產(chǎn)生熒光,通常本底較高,所以在臨床上使用可能會有假陽性發(fā)生。SYBRGreenI的優(yōu)點:
3、SYBRGreenI的優(yōu)點是因為其缺點產(chǎn)生,由于它能所有的雙鏈DNA相結(jié)合,所以對不同模板不需特別定制不同的特異性探針,通用性較好,并且價格相對較低。這對科研是很有利的,因此國內(nèi)外在科研中使用比較普遍。(2)水解探針模式(taqman探針)TaqMan探針是一種寡核苷酸探針,熒光基團連接在探針的5’末端,而淬滅劑則在3’末端。當探針與靶序列配對時,熒光基團發(fā)射的熒光因與3’端的淬滅劑接近而被淬滅。在進行延伸反應時,聚合酶的5’外切酶活性
4、將探針切斷,使得熒光基團與淬滅劑分離,發(fā)射熒光。一分子的產(chǎn)物生成就伴隨著一分子的熒光信號的產(chǎn)生。隨著擴增循環(huán)數(shù)的增加,F(xiàn)RET探針又稱雙雜交探針,F(xiàn)RET探針由兩條相鄰探針組成,在一條探針的5`端標記FAM熒光基團,另一探針的3`端標記Red640熒光基團。當復性時,探針結(jié)合在模板上,F(xiàn)AM基團和Red640基團相鄰,激發(fā)FAM產(chǎn)生的熒光,作為Red640基團的激發(fā)光被吸收,使Red640發(fā)出波長為640的熒光。當變性時,探針游離,兩基
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