柑橘單核苷酸多態(tài)性分子標(biāo)記的篩選及其在遺傳多樣性研究中的應(yīng)用.pdf

1、柑橘作為世界上重要的果樹樹種之一，有著重要的生產(chǎn)和科研價(jià)值。但由于柑橘種屬間易雜交、芽變頻率高和栽培歷史悠久等原因，導(dǎo)致柑橘種屬間親緣關(guān)系復(fù)雜，分類系統(tǒng)至今未有定論。開發(fā)利用分子標(biāo)記對(duì)柑橘類果樹的多態(tài)性進(jìn)行評(píng)價(jià)，有可能為該問題提供解決途徑。
　　 單核苷酸多態(tài)性是由單個(gè)堿基變異引起的DNA序列多態(tài)性，是第三代遺傳標(biāo)記物。單核苷酸變異發(fā)生位置多、頻率高、穩(wěn)定性好，適合規(guī)?；治?。開發(fā)利用單核苷酸多態(tài)性分子標(biāo)記，可以對(duì)柑橘的種質(zhì)資源

2、進(jìn)行多態(tài)性評(píng)價(jià)，可以探討柑橘種屬間的分類進(jìn)化關(guān)系，還以用于基因作圖及整合作圖、還可以研究基因功能、進(jìn)行分子標(biāo)記輔助育種等。因此，單核苷酸多態(tài)性標(biāo)記對(duì)于柑橘的遺傳與育種具有重要的理論和實(shí)際應(yīng)用價(jià)值，應(yīng)用前景廣闊。
　　 在本論文中，以38個(gè)柑橘及其近緣屬植物為材料，利用PCR-SSCP方法篩選分析SNP分子標(biāo)記，從84對(duì)引物中篩選出了有多態(tài)性PCR產(chǎn)物的引物18對(duì)，并對(duì)其中10對(duì)引物的PCR產(chǎn)物進(jìn)行了克隆測(cè)序，共得到157個(gè)SNP

3、位點(diǎn)，包括一個(gè)14堿基的InDel位點(diǎn)，這些位點(diǎn)多為二等位性，僅6個(gè)SNP位點(diǎn)是三等位性。對(duì)PCR-SSCP的譜帶分型、測(cè)序的結(jié)果進(jìn)行了聚類分析，結(jié)果表明，真正柑橘果樹類可分為五個(gè)大的類群，第一類是枳和飛龍枳，第二類為澳指檬，第三類為宜昌橙和三山香圓，第四類是檸檬、來檬、枸櫞和柚，第五類是甜橙、寬皮柑橘、雜柑和金柑，這一結(jié)果與前人的研究基本一致。結(jié)果還表明，利用少數(shù)不同的SNP組合能夠區(qū)分開大部分樣本，可以用于柑橘雜種和品種的鑒定。