笛鯛屬魚類長波段視蛋白(LWS)基因序列與進化的比較分析.pdf

1、笛鯛屬(Lutjanus)魚類隸屬鱸形目(Perciformes)笛鯛科(Lutjanidae)，是廣泛分布于熱帶和亞熱帶的巖礁魚類，是我國南海海域重要的經(jīng)濟魚類。本文從分子系統(tǒng)進化和基因序列分析兩個方面來闡述笛鯛屬魚類在進化與序列結(jié)構(gòu)組成的關(guān)系，本研究選取線粒體片段(CO I)中性標(biāo)記和功能性核基因(LWS)進行系統(tǒng)比較分析笛鯛魚類的進化關(guān)系與物種形成，而且通過對LWS基因序列的分析對其結(jié)構(gòu)作進一步的了解。
　　由于本文選取的對

2、象為14種笛鯛屬魚類，因此利用DNA條碼鑒定和篩選出的各物種典型標(biāo)本是有必要的。本文還選取了19種外群物種(其中包括脊椎動物和無脊椎動物)的LWS序列與本研究擴增得到的14種笛鯛魚類的LWS基因進行系統(tǒng)進化分析，其結(jié)果表明無脊椎動物和陸生脊椎動物各聚為一支且兩棲類介于陸生脊椎動物和魚類之間。而笛鯛魚類一支與中性標(biāo)記相比顯示在奧氏笛鯛和畫眉笛鯛之間，四帶笛鯛和孟加拉笛鯛之間，及馬拉巴笛鯛、紅鰭笛鯛和千年笛鯛之間的分子進化關(guān)系較為近。從進化

3、樹可以看到藍(lán)色笛鯛(四帶笛鯛和孟加拉笛鯛)和紅色笛鯛(馬拉巴笛鯛、紅鰭笛鯛和千年笛鯛)分別聚在一起這與形態(tài)學(xué)分類系統(tǒng)中所側(cè)重的體色、體側(cè)帶型等外部形態(tài)特征有明顯的相關(guān)性。在高級階元上，氨基酸序列比對分析所得到的進化關(guān)系與形態(tài)學(xué)分類是一致，即笛鯛屬、鯉形目(斑馬魚、金魚)和陸生脊椎動物(人、鼠和蜥蜴)各自聚為一支。但在笛鯛屬的進化支中聚類關(guān)系與中性標(biāo)記的系統(tǒng)進化樹相比，畫眉笛鯛和奧氏笛鯛的發(fā)生了分離，在氨基酸180號位點中畫眉笛鯛是A而奧

4、氏則為S。這暗示著，在笛鯛屬魚類生態(tài)重疊區(qū)域(即地理隔離不完全)的物種分化過程中視蛋白LWS基因的選擇性進化可能扮演了重要角色。
　　本研究測定了紅鰭笛鯛(Lutjanus erythopterus)和約氏笛鯛(Lutjanus johni)的cDNA的部分序列以及其3’UTR序列。其中紅鰭笛鯛包含可讀編碼框為693 bp，編碼230個氨基酸，約氏笛笛鯛包含可讀編碼框690 bp，編碼229個氨基酸，而紅鰭笛鯛3’UTR為176