30849.蛋白質(zhì)若干結(jié)構(gòu)預(yù)測問題研究及其軟件實現(xiàn)

1、浙江大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院博士學(xué)位論文蛋白質(zhì)若干結(jié)構(gòu)預(yù)測問題研究及其軟件實現(xiàn)姓名：顧斐申請學(xué)位級別：博士專業(yè)：生物信息學(xué)指導(dǎo)教師：吳平陳杭20090112浙江大學(xué)博士學(xué)位論文段，通過對二級結(jié)構(gòu)片段特征信息的訓(xùn)練得出三種二級結(jié)構(gòu)類型的代表性特征向量，并將其作為預(yù)測的依據(jù)。二級結(jié)構(gòu)片段定位中用到的方法為小波變換法，片段類型的訓(xùn)練和預(yù)測過程中用到的算法為直接平均法。本論文提出的蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測方式較為新穎，并且具有生物學(xué)意義。在蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測

2、中用到的是CB396數(shù)據(jù)集，這個數(shù)據(jù)庫具有低序列相似度和低序列冗余度的特性，并且已經(jīng)有多種方法對該數(shù)據(jù)庫做了測試，方便了本論文結(jié)果與其它方法結(jié)果的比較。從結(jié)果看，本論文的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測正確率(Q，)達到7021％，SOV的正確率為6714S。這一結(jié)果與現(xiàn)有的方法相比相差無幾。最后，利用蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)類的信息，得到了蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)類傾向性因子這一特征信患，該特征信息比傳統(tǒng)的傾向性因子更能反映氨基酸對二級結(jié)構(gòu)的偏好性。(4)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測軟件編寫根據(jù)