蛋白質(zhì)結構折疊分析與速率預測.pdf

1、蛋白質(zhì)是生物體內(nèi)存在最多的物質(zhì)，在生命體的各項活動中擔當著重要的角色。蛋白質(zhì)的折疊問題是生物物理學的重要課題之一，主要研究蛋白質(zhì)的序列、結構與功能三者之間的關系。蛋白質(zhì)折疊研究的兩個方向為:結構與序列之間的關系，以及序列、結構和折疊速率的關系。
　　1、熒光光譜法在研究蛋白質(zhì)的折疊構象變化及對蛋白質(zhì)進行定量分析方面都起到重要的作用。本章探討了熒光光譜的概念、發(fā)光機理及特點，分析了熒光光譜法研究蛋白質(zhì)折疊的機理，對熒光光譜技術在檢測

2、蛋白質(zhì)的構象變化、測定蛋白質(zhì)含量以及性質(zhì)方面的應用進行了綜述。
　　2、基于蛋白質(zhì)的2D HP模型，運用蒙特卡洛算法，在計算機上模擬了蛋白質(zhì)折疊的過程。用不同的氨基酸親疏水的劃分法，分析了五種不同疏水性特征的劃分對蛋白質(zhì)折疊的最小能量構象及其能量值的影響情況。2D HP模型的實驗結果表明，不同的氨基酸疏水特征劃分法對同一段蛋白質(zhì)序列的折疊構象及最小能量影響較大;同一段序列在同一種親疏水劃分法中，從序列的正向及其反向分別開始模擬蛋白

3、質(zhì)折疊構象，蛋白質(zhì)折疊結構的能量與蛋白質(zhì)折疊的起始位置無關，與其構象之間存在一定的關系。
　　3、從蛋白質(zhì)的一級結構出發(fā)，預測氨基酸的親疏水性對蛋白質(zhì)折疊速率的影響。本章從20種氨基酸中的每種氨基酸親疏水值出發(fā)，分析了氨基酸的親疏水性對蛋白質(zhì)折疊速率的影響。得出結論，20種氨基酸中的每種氨基酸親疏水特征值之和是影響蛋白質(zhì)折疊速率重要因素之一。
　　4、從蛋白質(zhì)的三維結構出發(fā)，分別提取氨基酸主鏈上的碳α原子(Ca)、氮原子(N