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文檔簡介
1、河北大學碩士學位論文基于18SrRNA、16SrRNA、COⅠ、COⅡ基因的蝗總科系統(tǒng)發(fā)育研究姓名:徐淼洋申請學位級別:碩士專業(yè):動物學指導教師:張道川印紅20090501捅要曼皇曼曼皇曼鼉皇曼曼皇皇量————————I—II———II——I曼!曼!蘭曼曼曼曼曼含量最高,達558%,這說明密碼子的堿基使用頻率存在明顯的偏向性,在氨基酸組成上:不含半胱氨酸(Cys)和色氨酸(Trp),含量最多的是亮氨酸(Leu)和蘇氨酸(Thr);反映出
2、COI、COII基因在氨基酸組成上具一定的偏向性。2核酸序列的堿基變異和編碼蛋白基因的飽和度分析:18SrRNA基因序列轉換大于顛換,R(轉換/顛換)值為I3;16SrRNA基因序列顛換大于轉換,R值為O8;COI基因序列轉換與顛換比值總體為08,核苷酸替換主要發(fā)生在密碼子第3位點上,且顛換高于轉換,R值為O5,在遺傳距離02時,TV(顛換)超過了TS(轉換),TS、TV與遺傳距離之間有很好的線性關系,均呈上升趨勢,未達到飽和;COII
3、基因序列轉換與顛換比值總體為O7,核苷酸替換主要發(fā)生在密碼子第3位點上,且顛換高于轉換,R值為06,在遺傳距離02時,TV超過了TS,Tv與遺傳距離之間有很好的線性關系,呈上升趨勢,未達飽和,但TS隨著P距離的增大逐漸趨于穩(wěn)定,已達飽和。3蝗總科遺傳距離比較:通過對蝗總科8個科10種昆蟲的18SrRNA、16SrRNA、COI、COII基因序列進行比對分析得出:蝗總科科間遺傳距離分別為:0000“0023,0048“0235,O125“
4、0254,0095t0298;與外群螻蛄總科(Gryllotalpoidea)東方螻蛄(Gryllotalpaoriental&)的遺傳距離分別為:0089“0099,0307“0377,0279~0355,0379“0444。4系統(tǒng)發(fā)育重建結果分析:采用MEGA軟件和PHYLIP軟件分別利用蝗總科8個科10種昆蟲的18SrRNA、16SrRNA、COI、COII基因序列和對4條DNA序列進行整合的序列構建NJ系統(tǒng)發(fā)育樹,都能夠得到較為
5、一致的系統(tǒng)發(fā)育樹,外群螻蛄總科東方螻蛄首先從樹的根部與蝗總科10種昆蟲完全分離開來,蝗總科的昆蟲以較高的置信度聚在一起;錐頭蝗科和瘤錐蝗科以較高的置信度聚在一起,置于系統(tǒng)發(fā)育樹根部,構成了蝗總科的原始類群;癩蝗科與斑腿蝗科、斑翅蝗科、網(wǎng)翅蝗科、棒角蝗科和劍角蝗科以較高的置信度聚一起;斑翅蝗科的亞洲小車蝗(Oedaleusasiaticus)和亞洲飛蝗(Locustamigratoriamigratoria)以較高的置信度聚為一支;而斑腿
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