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文檔簡介
1、西南大學碩士學位論文家蠶赤蟻突變的分子定位及淡赤蟻(ch)的分子基礎初探姓名:黃永燕申請學位級別:碩士專業(yè):遺傳學指導教師:代方銀魯成20100501西南大學碩學位論文篩選,找劍了10對在兩個親本間表現(xiàn)多態(tài)性的引物,再用這10對引物對2個親本、Fl代和連鎖分析組合BClF群體的20個個體(10個正常個體和lO個表現(xiàn)赤蟻的個體),共23個個體基因組DNA進行PCR擴增和PAGE電泳檢測,篩選到5對與標記基因血連鎖的SSR標記:S0903、
2、S0904、S0907、S0908和S0910。用這5對SSR標記對億突變基因的定位分析組合BClM群體的100個個體基因組DNA進行SSRPCR分析,經過數據統(tǒng)計和分析,利用作圖軟件得到突變基因和與它們連鎖的5個SSR標記的連鎖圖。連鎖SSR標記與突變基因腸在連鎖圖上的順序依次為:S0907、Ia、S0904、S0903、S0908、S0910。連鎖圖的遺傳距離是444cM,距離腸最近的SSR標記是S0904,圖距為10eM。(3)隱
3、性赤蟻如基因的分子定位利用屬于家蠶第13連鎖群的共11對SSR引物在定位系統(tǒng)親本Dazaoch和近交系C108間篩選得到了7對有多態(tài)性的引物。用兩個親本、F1代和BClF代共23個個體基因組進行了連鎖驗證,找到了5對與標記基因連鎖的SSR標記:S1308、S1309、S131l、S1312和S2213。用這5對標記對幽的定位分析組合BClM群體的166個個體基因組DNA進行SSRPCR分析,經過數據統(tǒng)計和分析,將砌基因定位于標記S130
4、9和S2213之間,距離如最近的標記是S1309,圖距為73eM;eh距離標記S2213遺傳距離為91eM。(4)淡赤蟻(∥)的分子基礎初探在已知赤蟻突變嘲與yellow基因有關的情況下,根據NCBI上yellow基因的CDS序列跨ORF設計引物擴增等位基因淡赤蟻(ohp)eDNA中yellow基因,得到兩種剪接方式的表達??寺〔y序,chptypel屬于插入型突變,在第3外顯子前插入不規(guī)律的一段序列,由TAA引起翻譯提前終止。c礦ty
5、pe2屬于缺失型突變,由第2外顯子和第4外顯子直接相連,缺失整個第3外顯子共189bp(終止密碼子與野生型相同)。其中,typel為淡赤蟻所特有的剪接方式,通過對其編碼氨基酸的序列、糖基化位點分析、功能域預測及高級結構等分析,初步推測其為導致淡赤蟻表型的分子基礎。實驗結果表明,yellow基因從家蠶胚胎期的12h就開始表達。yellow基因在家蠶的頭部中高量表達,此處為淡赤蟻與正常大造表型差異最明顯的地方,說明yellow基因參與了家蠶
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