24946.一年生與多年生植物在全基因組水平的dna替代整度的比較

1、碩士學(xué)位論文MSDissertation一年生與多年生植物在全基因組水平的DNA替代速度的比較TheGenomewideInvestigationontheEvolutionaryRateHeterogeneitybetweenAnnualsandPerennials李晉鵬JinpengLi導(dǎo)師：楊四海副教授田大成教授Memor：AssociateProfSihaiYangProfDachengTian南京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院Schoolo

2、fLifeSciences，NanjingUniversity南京中國(guó)甬尿甲崮Nanjing，China2011年5月May，20112QQ晝級(jí)碩士生姓名：指導(dǎo)教師(姓名、職稱)：拯四篷副塾援冒太盛塾援摘要世代周期一直以來(lái)被認(rèn)為是影響物種分子演化速度的關(guān)鍵因素之一而被人們所關(guān)注。在植物中，類似的研究主要集中在具有不同生活史的一年生植物和多年生植物中。由于基因組數(shù)據(jù)的缺乏，之前的研究只涉及少數(shù)的位點(diǎn)而得不到一致的結(jié)論?；谛陆l(fā)布的5個(gè)模

3、式植物的基因組數(shù)據(jù)，我們綜合了85個(gè)管家基因，lO個(gè)非管家基因家族及34個(gè)葉綠體基因的數(shù)據(jù)在全基因組范圍來(lái)研究一年生植物與多年生植物分子演化速度的差異。實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示，在我們選取的基因中，739％834％的核基因和714％971％的葉綠體基因在一年生植物中有更高程度的核苷酸替代。這一趨勢(shì)在同義替代位點(diǎn)和非同義替代位點(diǎn)都保持一致。符號(hào)檢驗(yàn)和成對(duì)t檢驗(yàn)都顯著地拒絕演化速度一致的零假設(shè)而接受一年生植物演化速度快的備擇假設(shè)。該研究的另一個(gè)發(fā)現(xiàn)是物