水稻兩亞種的LATERAL ORGAN BOUNDARIES domain基因家族比較與進(jìn)化分析.pdf

1、植物特有的LATERALORGANBOUNDARIES(LOB)domain基因家族在側(cè)生組織的發(fā)育中起著潛在的作用?；诂F(xiàn)有的水稻兩亞種數(shù)據(jù)庫，35個粳稻(日本晴)LBD基因(命名為OsJLBD)和相同數(shù)量的秈稻(9311)基因(命名為OsILBD)被鑒定出來。在水稻的兩亞種中都發(fā)現(xiàn)一種新的水稻LBD基因有著兩個LOBdomain，并被預(yù)測出有兩個盤繞圈的結(jié)構(gòu)，在現(xiàn)有的NCBIGenbank數(shù)據(jù)庫中并未發(fā)現(xiàn)其他植物中有這樣的LBD基因

2、。OsJLBD和OsILBD基因有著相似的染色體分布，且都可以被分為7個亞類(subclasses)(classIa，Ib，Ic，Id，Ie和classⅡ，classⅢ)，但沒有亞類特有的表達(dá)譜。ClassIe中的水稻兩亞種LBD基因都沒有被預(yù)測出有內(nèi)含子。相比擬南芥LBD基因家族，基因組復(fù)制和串聯(lián)復(fù)制導(dǎo)致了LBD基因在水稻中產(chǎn)生新功能，從而形成新的亞類，但是二倍體化機制和較少的串聯(lián)復(fù)制導(dǎo)致了相比擬南芥，水稻中LBD基因的數(shù)量反而減少了