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文檔簡介
1、海濱木槿(Hibiscus hamabo Sieb.et Zucc.)屬于錦葵科木槿屬,是一種落葉小喬木。該植物對鹽堿有較強的耐受性,能生長在堿性(p H8.0~8.6)、含鹽量高達1.5%的土壤中,是典型的鹽生植物。目前有關(guān)海濱木槿耐鹽性的研究主要集中在生理角度,而在分子機制方面的研究卻很少。本實驗從轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組兩方面進行分析,初步探究鹽脅迫下海濱木耐鹽性的分子機制,希望為更加深入的了解海濱木槿耐鹽的分子調(diào)控機制和更好地推廣及綜合
2、利用海濱木槿提供理論依據(jù)。
本研究主要內(nèi)容包括:⑴用200mM的NaCl處理長到10片真葉的海濱木槿1 d,以未處理的作為對照,取其葉和根進行轉(zhuǎn)錄組測序。共測序了4個樣品,得到20.52Gb Clean Data,每個樣品Clean Data都達到4.50 Gb,Q30堿基百分比在93.00%及以上。組裝后,共獲得75,257條 Unigene,其中1 kb長度以上的 Unigene有17,795條。將得到的 Unigene與
3、 NR、Swiss-Prot、KEGG、COG、KOG、GO和 Pfam數(shù)據(jù)庫進行比對,共得到44,483條 Unigene的注釋結(jié)果。對 Unigene庫進行SSR分析,共獲得6,271個 SSR標記。對得到的差異表達基因進行模式聚類、功能注釋以及富集性分析?;诨蛟诓煌瑯悠分械谋磉_量,識別差異表達基因,200 mM NaCl脅迫下轉(zhuǎn)錄組測序中海濱木槿處理組的葉與對照組的葉相比,得到1268個差異表達基因,其中上調(diào)的有375個基因,
4、下調(diào)的有893個基因;而處理組的根與對照組的根相比,得到2093個差異表達基因中上調(diào)的基因有935個,下調(diào)的基因有1104個。從差異表達基因中,選取了17個基因進行熒光定量 PCR驗證,證明了轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的可靠性,說明轉(zhuǎn)錄組的數(shù)據(jù)可以用來做進一步研究。⑵根據(jù)轉(zhuǎn)錄組結(jié)果,選取了與抗鹽相關(guān)的4個差異表達基因(APX、GST、SOD和AKT1),發(fā)現(xiàn)在鹽脅迫下海濱木槿葉片中APX、GST、SOD和AKT1這四個基因的表達量都呈現(xiàn)先上升后下降的趨
5、勢,在3d的時候達到最大;而在海濱木槿根中這四個基因的表達量基本上呈現(xiàn)出上升-下降-上升的趨勢。測定200mM NaCl處理0 d、1 d、3 d、6d、9d的海濱木槿葉片和根中的APX、SOD、GST的酶活,發(fā)現(xiàn)海濱木槿葉片中APX、SOD的酶活性表現(xiàn)出先升高后下降的趨勢, GST的酶活呈現(xiàn)出上升-下降-上升的趨勢。APX的酶活在6d的時候達到最大,GST、SOD酶的活性在第3 d時達到最大。而海濱木槿根中APX酶活性差異卻不顯著,基
6、本沒有什么變化,GST的酶活基本呈現(xiàn)出下降的趨勢,SOD酶的活性則表現(xiàn)出先升高后降低的趨勢,在第6 d時酶活性最大。以上結(jié)果說明海濱木槿在遭受鹽脅迫時,抗性基因最先做出響應(yīng),然后再通過轉(zhuǎn)錄翻譯合成相關(guān)的抗性蛋白,從而使植物抵抗環(huán)境脅迫。⑶用200mM的NaCl處理海濱木槿,以不含NaCl的1/2 Hoagland營養(yǎng)液澆灌為對照,取脅迫1d的海濱木槿的葉提取總蛋白,進行雙向電泳,每個樣品進行三次技術(shù)重復(fù)。使用 PDQ ues t軟件對圖
7、像進行分析,對蛋白豐度表達差異為 P≤0.05且 ANOVE≥2的點標記,發(fā)現(xiàn)在鹽脅迫下,與對照相比,200 mM的NaCl處理1 d后的海濱木槿葉中有86個蛋白質(zhì)點表現(xiàn)出顯著性差異,其中蛋白質(zhì)豐度增加的有54個,蛋白質(zhì)豐度降低的有32個。對這些差異蛋白點進行質(zhì)譜分析,總共檢測出77種差異蛋白,其中48種是上調(diào)的,29種是下調(diào)的。對這些差異蛋白進行 GO富集分析和 Pathway富集分析,將這些差異蛋白進行分類,主要分類到光合、代謝、蛋
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