衰老相關(guān)的外周全血基因表達(dá)與DNA甲基化標(biāo)志物的可重復(fù)性.pdf

1、衰老的主要特征是生理功能的退化,這種退化具有較大的個體差異性。確定可靠、易測的衰老生物學(xué)標(biāo)志物以代替時序年齡進(jìn)行衰老評估對阿茲海默癥(Alzheimer’s disease)等衰老相關(guān)疾病的發(fā)病機理研究及輔助診斷具有重要的意義。利用易于臨床獲取的外周全血,越來越多的研究發(fā)現(xiàn)了一些在外周全血中與衰老相關(guān)的基因表達(dá)與DNA甲基化標(biāo)志物,但目前還缺少研究系統(tǒng)地評價這些衰老相關(guān)標(biāo)志物的可重復(fù)性。
　　我們首先利用來自不同實驗室的多套外周全

2、血的表達(dá)譜和甲基化譜數(shù)據(jù)集,分別分析了由獨立數(shù)據(jù)集獲得的與衰老相關(guān)的基因表達(dá)和DNA甲基化標(biāo)志物是否具有顯著的一致性。結(jié)果發(fā)現(xiàn)在不同數(shù)據(jù)集中找到的與年齡相關(guān)的差異表達(dá)基因(age-associated differentially expressed genes, aDEG)或差異甲基化位點(age-associated differentially methylated sites, aDMS)均具有顯著的一致性(p<4.72*E-0

3、5),表明利用芯片高通量技術(shù)在全血中獲得的與衰老相關(guān)的基因表達(dá)與DNA甲基化標(biāo)志物具有可重復(fù)性。我們進(jìn)一步利用去卷積算法估計了各樣本中主要白細(xì)胞亞型的比例,并分析了特定亞型白細(xì)胞上衰老相關(guān)分子的改變。結(jié)果顯示:
　　(1)隨著年齡增加,全血中髓系細(xì)胞的比例顯著增加而淋巴細(xì)胞的比例顯著減少;
　　(2)在全血中觀察到的aDEG主要反映血細(xì)胞的組分隨年齡改變而產(chǎn)生的差異表達(dá)信號;
　　(3)在全血中觀察到的aDMS主要反映

4、血細(xì)胞上的甲基化異常。
　　最后,我們分別將在正常人外周全血中觀察到的aDEG、aDMS與在阿茲海默癥患者的外周全血或白細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)的相應(yīng)分子標(biāo)志物進(jìn)行比較,結(jié)果顯示:
　　(1)和整個年齡段的aDMS相比,在外周全血中65歲以上的aDMS與阿茲海默癥相關(guān)的差異甲基化基因有較高的一致性,其中已知一些基因可作為潛在的阿茲海默癥的分子標(biāo)記;
　　(2)血細(xì)胞上的aDEG與阿茲海默癥相關(guān)的差異表達(dá)基因之間沒有顯著的關(guān)聯(lián)。