甲狀腺癌血DNA甲基化譜的研究.pdf

1、東華大學(xué)碩士學(xué)位論文甲狀腺癌血DNA甲基化譜的研究姓名：廖萍申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：碩士專(zhuān)業(yè)：生物化學(xué)與分子生物學(xué)指導(dǎo)教師：王文靜;劉茶珍2012-01-09( p < ：5 E ．4 和p < _ 1 E ．4 ) 分別進(jìn)行建模，通過(guò)已有甲基化數(shù)據(jù)和輔助特征綜合構(gòu)建疾病預(yù)測(cè)模型。在閾值為p = l E ．4 時(shí)篩選出來(lái)的8 個(gè)差異甲基化基因?qū)τ诩膊☆A(yù)測(cè)平均準(zhǔn)確度達(dá)到了9 1 ．6 7 ％，高于另一閾值，具有較優(yōu)的預(yù)測(cè)甲狀腺癌的能力。

2、為達(dá)到驗(yàn)證這些基因的目的，我們分析了在病例組中顯著高甲基化基因，根據(jù)文獻(xiàn)報(bào)道、實(shí)驗(yàn)檢測(cè)數(shù)據(jù)、已知的蛋白功能，生物學(xué)通路等信息先選擇O X T R 基因進(jìn)行甲基化特異性P C R 的驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)，用簡(jiǎn)便易行的方法篩選出有意義的高甲基化基因。利用R A A 技術(shù)擴(kuò)增甲狀腺癌患者與正常對(duì)照外周血小片段D N A 甲基化( M ) 和非甲基化( U ) O X T R 基因各1 5 例。其中，甲狀腺癌病例組1 l 例樣品O X m M和O x T

3、R ．U 條帶皆有擴(kuò)增，4 例僅有O x T R - U 條帶擴(kuò)增，O x T R - M陽(yáng)性率達(dá)到7 3 ％；正常對(duì)照組1 例樣品O X m M 和O X T R _ U 條帶皆有擴(kuò)增，其余1 4 例樣品僅有O X 噥_ U 條帶擴(kuò)增，O X T R - U 條帶陽(yáng)性率達(dá)到9 3 ％。通過(guò)高通量芯片技術(shù)已獲得了甲狀腺癌血D N A 甲基化譜，并且通過(guò)實(shí)驗(yàn)室P C R 技術(shù)驗(yàn)證了其中的一個(gè)有意義的高甲基化基因O X T R ，它在甲狀腺