伴童年創(chuàng)傷抑郁癥患者DNA甲基化譜研究.pdf

1、目的:本研究利用全基因組DNA甲基化測序技術(shù)，探討DNA甲基化修飾改變與童年創(chuàng)傷和抑郁癥之間的關(guān)系，初步了解DNA甲基化在童年創(chuàng)傷和抑郁癥機(jī)制中的作用。
　　方法:本研究分為伴童年創(chuàng)傷抑郁癥患者組、不伴童年創(chuàng)傷抑郁癥患者組、伴童年創(chuàng)傷健康成人組和不伴童年創(chuàng)傷健康對照組共四組，每組各3例。分別抽提各樣本外周血組織中的基因組DNA，并采用MeDIP-Seq(Methylated DNA Immunoprecipitation sequ

2、encing)測序技術(shù)進(jìn)行DNA甲基化測序。
　　結(jié)果:通過運(yùn)用MeDIP-seq測序技術(shù)，本階段獲得測序深度足夠和高分辨率的外周血全基因組DNA甲基化譜。本次測序結(jié)果的整體原始數(shù)據(jù)高達(dá)60Gb，組間比較、GO(gene ontology)功能分析和Pathway分析后整體數(shù)據(jù)約80Gb。根據(jù)分析伴童年創(chuàng)傷抑郁癥患者組與伴童年創(chuàng)傷健康成人組相比呈低甲基化改變的基因有11，623個(gè)，呈高甲基化改變的基因有12，772個(gè)。伴童年創(chuàng)傷抑

3、郁癥患者組與不伴童年創(chuàng)傷抑郁癥患者組相比呈低甲基化改變的基因有12，838個(gè)，呈高甲基化改變的基因有12，709個(gè)。伴童年創(chuàng)傷健康成人組和不伴童年創(chuàng)傷健康對照組相比呈低甲基化改變的基因有12，228個(gè)，呈高甲基化改變的基因有12，664個(gè)。不伴童年創(chuàng)傷抑郁患者組和不伴童年創(chuàng)傷健康對照組相比呈低甲基化改變的基因有12，039個(gè)，呈高甲基化改變的基因有13，661個(gè)。GO分析顯示甲基化異常改變明顯的基因類型包括:生物進(jìn)程的(biologic