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文檔簡介
1、本文綜合運用線粒體DNA多基因(控制區(qū)、細胞色素b基因、16SrRNA基因和COII基因)序列聯(lián)合分析和微衛(wèi)星DNA標記技術研究了不同倍性團頭魴(團頭魴同源四倍體、倍間正交三倍體、倍間反交三倍體、倍間異源三倍體以及二倍體“浦江1號”)五群體的遺傳差異,探索了加倍染色體組對多倍體分子遺傳特性的影響,為團頭魴多倍體的繁殖、保護和種群復壯提供了重要的分子生物學參考資料,也可為闡明某些自然擬四倍體物種(如鯉、虹鱒等)的起源提供理論依據。主要研究
2、結果如下: 1.不同倍性團頭魴線粒體DNA序列變異 通過對線粒體控制區(qū)、細胞色素b基因、16SrRNA基因和COII基因序列的聯(lián)合分析,研究了不同倍性團頭魴五群體的遺傳多樣性和遺傳分化關系。結果表明:①在所分析的3283bp片段中,T、C、A、G4種核苷酸的平均含量分別為27.18%、25.45%、30.71%、16.66%。②核苷酸變異類型有轉換、顛換、插入/缺失4種。確定了55種單倍型,群體間無共享單倍型,五群體的單
3、倍型多樣度在0.9848~1.0000之間,說明不同群體內單倍型類型豐富。③五群體內各序列平均核苷酸差異數(shù)在8.000~24.273之間,核苷酸多樣度在2.483‰~7.866‰之間;群體間雙參數(shù)距離范圍為0.0039~0.0106,表明不同倍性團頭魴五群體遺傳多態(tài)性豐富。④對線粒體序列變異的分子方差分析和聚類分析的結果表明:不同倍性團頭魴五群體間出現(xiàn)顯著的遺傳分化,分子系統(tǒng)樹分成明顯的兩支,表明五群體有2個母系來源。 2.不同
4、倍性團頭魴微衛(wèi)星標記遺傳差異 從分離得到的鯉魚包含CA重復單元的微衛(wèi)星DNA標記中選取了2對有效引物(MFW1,MFW19),對不同倍性團頭魴進行微衛(wèi)星分析。結果表明:①2對微衛(wèi)星引物在不同倍性團頭魴五群體中探測到的等位基因數(shù)為4~6個不等,大小在131~307bp之間。其中,MFW19-175和MFW19-256這兩個等位基因可以作為異源3n特異的微衛(wèi)星DNA標記。②不同倍性團頭魴五群體內的Shannon多樣性指數(shù)在0.056
5、2~0.2887之間,Nei's基因多樣性指數(shù)在0.0315~0.1969之間,平均遺傳距離在0.0395~0.1542之間;五群體間的Nei's遺傳距離在0.0528~0.4183之間,表明不同倍性團頭魴五群體遺傳多態(tài)性豐富。③Shannon多樣性指數(shù)和Nei's基因多樣性指數(shù)在五群體間的變化趨勢一致,即:反交3n>異源3n>正交3n>同源4n-F1>2n,而且,反交3n、異源3n、正交3n和同源4n-F1群體的Shannon多樣性指
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