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文檔簡介
1、胃癌是全球惡性腫瘤死亡率的第二位,胃癌預(yù)后與診斷時期密切相關(guān)。但是目前臨床上缺乏高敏感性和特異性的有效胃癌診斷分子標(biāo)志物。尋找和驗證新的胃癌變監(jiān)測和早期診斷分子標(biāo)志物,對胃癌診斷和早期治療具有重要意義。
本研究通過胃癌、癌前病變、健康志愿者外周血樣本miRNA測序發(fā)現(xiàn)了一組胃癌癌變相關(guān)的miRNA,通過聚類分析及統(tǒng)計學(xué)方法篩選出可能的胃癌相關(guān)差異表達(dá)miRNA,并通過qRT-PCR技術(shù)驗證得到miR-331-3p和miR-19
2、7在胃癌、癌前病變、健康人外周血中存在明顯差異表達(dá)。同時,我們通過Logistic回歸方法建立的基于qRT-PCR檢測分析的胃癌監(jiān)測模型,并擴大樣本對普通人群進(jìn)行檢測,發(fā)現(xiàn)miR-331-3p和miR-197在健康人、癌前病變患者、胃癌患者外周血中的表達(dá)呈不同變化走向,并能基本區(qū)分3類患者,證明聯(lián)合檢測miR-331-3p和miR-197可能具有對胃癌變過程進(jìn)行監(jiān)測,早期檢測胃癌的重要價值。miR-331-3p和miR-197可能成為潛
3、在的可用于臨床的胃癌變監(jiān)測和早期胃癌診斷的分子標(biāo)志物。
研究步驟
1.胃癌外周血miRNA測序及分析
①第二代高通量測序分別檢測6例胃癌患者、6例胃癌前病變患者、6例健康志愿者外周血樣本miRNA表達(dá)圖譜;
?、趯⑺袡z測到的小RNA與各類RNA的比對、注釋情況進(jìn)行總結(jié);
?、蹖Σ煌瑯悠分斜磉_(dá)的miRNA進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析,判斷其在胃癌患者、胃癌前病變患者、健康志愿者間表達(dá)量是否存在顯著性差異;
4、
?、茴A(yù)測可能與胃癌相關(guān)的新的miRNA。
2.胃癌外周血miRNA可能標(biāo)志物的篩選及初步驗證
?、偻ㄟ^聚類分析及統(tǒng)計學(xué)方法篩選進(jìn)一步驗證胃癌外周血分子標(biāo)志物的候選,miRNAs;
②利用實時PCR定量對6個候選miRNAs(miR-331-3p、miR-197、miR-23b*、miR-1260b、miR-3138、miR-3175)進(jìn)行小規(guī)模初步驗證(n=46,胃癌患者15例,胃癌前患者16例,健
5、康志愿者15例);
?、鄹鶕?jù)實時PCR結(jié)果,初步確定miR197和miR331-3p為潛在的分子標(biāo)志物,初步確定其判別胃癌的臨界值。
④對可能miRNA分子標(biāo)志物進(jìn)行靶基因預(yù)測,預(yù)測其可能生物學(xué)功能。
3.胃癌前病變癌變診斷模型的建立及普通人群監(jiān)測
?、俑鶕?jù)Logistic分析和qRT-PCR檢測結(jié)果,構(gòu)建miR197和miR331-3p胃癌檢測模型,分析ROC曲線,確定檢測敏感度和特異度。
6、?、谶M(jìn)行普通人群檢測(n=302),驗證胃癌檢測模型的檢測效能,評估聯(lián)合檢測miR197和miR331-3p在胃癌變各階段監(jiān)測的價值。
②qRT-PCR檢測分析miR197和miR331-3p外周血檢測對胃癌(n=95)和其他腫瘤(n=20)的腫瘤特異性區(qū)分能力。
研究結(jié)果
1.外周血miRNA測序結(jié)果提示胃癌、癌前病交、健康人的外周血清中存在一組差異表達(dá)的miRNAs。
2.根據(jù)外周血miRNA
7、測序結(jié)果,通過統(tǒng)計學(xué)分析,得到一組在胃癌、胃癌前病變及健康人之間可能存在差異表達(dá)的miRNAs: miR-331-3p、miR-197、miR-23b*、miR-1260b、miR-3138、miR-3175。
3.通過小規(guī)模qRT-PCR驗證和統(tǒng)計學(xué)分析,明確mir-23b*、mir-197、 mir-331-3p在胃癌與非癌人群外周血中存在顯著性差異表達(dá)。
4.通過Logistic回歸方法建立了基于qRT-PCR
8、檢測分析的胃癌監(jiān)測模型,并發(fā)現(xiàn)mir-197和mir-331-3p在區(qū)分癌與非癌時,具有較高的敏感度(74%)和特異度(72%)。
5.結(jié)合普通人群外周血的miRNAs分析,發(fā)現(xiàn)miR-331-3p和miR-197在健康人、癌前病交患者、胃癌患者外周血中的表達(dá)呈不同變化走向,其中胃癌組miR331-3p、miR-197表達(dá)同樣具有明顯差異性,但是區(qū)別在miR331-3p較癌前組表達(dá)更升高,而miR-197癌前組表達(dá)差異又可以將
9、癌前與叫胃癌組和正常組做區(qū)分均明顯升高。
6.小樣本外周血的miRNAs分析顯示,發(fā)現(xiàn)miR-331-3p和miR-197在胃癌患者和其他腫瘤患者外周血中不存在明顯的表達(dá)差異。
7.生物信息學(xué)分析提示miR331-3p和miR197的靶基因與腫瘤細(xì)胞增殖、凋亡及細(xì)胞周期調(diào)控密切相關(guān)。
研究結(jié)論
1.通過外周血miRNA測序得到一組在胃癌、胃癌前病變及健康人之間具有差異表達(dá)的miRNA。
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