SELDI蛋白芯片技術(shù)篩選腦膠質(zhì)瘤血清腫瘤標(biāo)記物的研究.pdf

1、青島大學(xué)碩士學(xué)位論文SELDI蛋白芯片技術(shù)篩選腦膠質(zhì)瘤血清腫瘤標(biāo)記物的研究姓名：陳曉東申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：碩士專業(yè)：神經(jīng)外科學(xué)指導(dǎo)教師：豐育功20090531A b s t r a c tO b j e c t i v e ： S c r e e n i n g d i f f e r e n tp r o t e i ni ns e r u m o f p a t i e n t s w i t hg l i o m a ，s e t u

2、p d i a g n o s t i cm o d e l a n dt ot e s tt h em o d e l ；I d e n t i f y i n g t h ep r o t e i ni n d a t a b a s e t oe x p l o r e t h ep a t h o g e n e s i so f g l i o m a ．M e t h o d s ：U s i n g s u r f a c

3、 e - e n h a n c e dl a s e rd e s o r p t i o ni o n i z a t i o n - t i m e o f f l i g h t m a s ss p e c t r o m e 時(shí)( S E L D I - T O F - M S ) c o m b i n e d w i t ha n i o ne x c h a n g e c h i p 州C X - 2 ) a n d

4、p r o t e i n ．c h i pt i m e - o f - f l i g h tm a s ss p e c t r o m e t e r t o d e t e c tt h es e r u m o f 3 0 c a s e so fg l i o m a p a t i e n t s a n d1 2h e a l t h y c o n t r o l sf o rs p e c t r a la n a

5、 l y s i so fp r o t e i n s ；U s i n gt h eB i o m a r k W i z a r dS y s t e r m s o f t w a r ea n a l y s i st h ep r o t e i n s p e c t r u m o fs e r u m , l o o k i n g f o r r e m a r k a b l y s t a t i s t i c

6、d i f f e r e n c e s i np r o t e i n e x p r e s s i o n ；U s e i n g B i o m a r k P a U e r nS y s t e r m s o f t w a r et oa n a l y s i sp r o t e i ns p e c t r u m t os e tu p t h ed i a g n o s t i cm o d e l o

7、 fg l i o m a ，a n dt e s tt h em o d e l ；I d e n t i f y i n gt h ep r o t e i ni nU n i p r o tp r o t e i nd a t a b a s e t oe x p l o r et h er o l et h a tt h ep r o t e i np l a y e d i nt h e p a t h o g e n e s

8、 i so fg l i o m a ．R e s u l t s ：5 k i n d so fp r o t e i nw h i c h h a dr e m a r k a b l y s t a t i s t i cd i f f e r e n c e sw e r e f o u n di np r e t h e r a p e u l i cg l i o m ag r o u p ，p o s t —t h e r

9、 a p e u t i c g l ! o m ag r o u p ，a n d h e a l t h yc o n t r o l g r o u pa t t h er a n g eo f 0 —5 00 0 0 D a ．T h e r ew e r e3k i n d so f p r o t e i nt h a t u p - e x p r e s s e di n t u m o rg r o u p s ，2

10、2 3 5 3 ±H ，3 3 2 8 ．5 + _ H ,1 1 1 1 9 ．8 + _ I - ID a ，2k i n d s o fp r o t e i nl o w - e x p r e s s e d ，7 5 1 7 ．3 ±H ，1 28 4 1 ．7 ±HD a ．T h e d a t ao f t h e5k i n d so fp r o t e i na b o v e —m

11、 e n t i o n e dw e r ea n a l y z e d b yT t e s t b e t w e e n t h ee a c ht w og r o u p s ，1 1 1 1 9 ．8 ±H ，1 28 4 1 ．7 ±HD ap r o t e i nc o n t e n ti np o s t - t h e r a p e u t i cg l i o m ag r o u p

12、 a n dt h eh e a l t h yc o n t r o lg r o u p h a d n os t a t i s t i c a ls i g n i f i c a n c e ；22 3 5 ．5 + _ I - I ，3 3 2 8 ．5 + _ 1 - I D ap r o t e i nb e t w e e n t h e s et w og r o u p sh a ds t a t i s t i

13、c a ls i g n i f i c a n c e ( P < 0 ．0 5 ) ；T h er e s tk i n d s o fp r o t e i ni ne a c hg r o u ph a dr e m a r k a b l ys t a t i s t i c a ls i g n i f i c a n c e( P < O ．0 1 ) ．B i o m a r kP a t t e r n S

14、 y s t e r ms o f t w a r e a u t o m a t i c a l l ys e l e c t e dt h e75 1 7 ．3 + H ，1 1 1 1 9 ．8 - - H ，1 28 4 1 ．7 + HD at o s e tu pa d i a g n o s t i c m o d e l i n o r d e r t o m a k e d i a g n o s i s o fg l

15、 i o m a ．T h ed i a g n o s t i ca c c u r a c yo f t h e g l i o m aw a s 9 5 ．8 ％( 2 3 ／2 4 ) ；a n d t h e d i a g n o s t i c a c c u r a c yo fh e a l t h y w a s 1 0 0 ％( 1 2 ／1 2 ) ；t h et o t a la c c u r a c yW

16、a s 9 7 ．2 ％( 3 5 ／3 6 ) ．P r o t e i nw i t hM W 75 1 7 ．3 ±HD a w a sf o u n d c o n f o r m i n gw i t hS P H A R i n U n i P r o t p r o t e i nd a t a b a s e ．a(chǎn) n d t h er e m a i n i n g4k i n d so fp r o t e

17、 i nw a s n o tr e l a t e dt o t h ec o r r e s p o n d i n g r e s u l t s ．C o n c l u s i o n ： 5k i n d so fp r o t e i nw h i c hh a dr e m a r k a b l y s t a t i s t i cd i f f e r e n c e sw e r e f o u n db yS

18、E L D I —T O F - M S a n di tc o u l d s c r e e nb i o m a r k e r s o f g l i o m ae f f i c i e n t l y , a n dt h ed i a g n o s t i cm o d e lb a s e do nt h i ss t u d yc a nb eu s e dt od i a g n o s eg l i o m aa

19、 c c u r a t e l y ．S P H A R a saD N A c r o s s l i n k i n ga g e n t sm a y b ep l a y e da ni m p o r t a n tr o l ei n t h es e m i c o n s e r v a t i v e s y n t h e s i so fD N A i nS - p h a s e o f t h ec e l

20、lc y c l e ，a n dm a y b e ap a t h o g e n i c f a c t o ro f g l i o m a ．T h e r e m a i n i n g 4k i n d s o fp r o t e i nw a s n o t r e l a t e dt o t h ec o r r e s p o n d i n g r e s u l t s ，b u tt h e yw e r

21、es t i l li m p o r t a n ti n t h ep a t h o g e n e s i so f g l i o m a ．P o s t g r a d u a t es t u d e n t ：C h e nX i a o d o n g ( N e u r o s u r g e r y )D i r e c t e db y P r o f ．：F e n g Y u g o n gK e y w