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文檔簡介
1、懷山藥(Dioscorea opposita Thunb.)是我國著名的“四大懷藥”之一,藥食兼優(yōu)。為解析其微型塊莖誘導(dǎo)形成的分子機制,本研究以其優(yōu)良種質(zhì)——鐵棍山藥為試材,在前期微型塊莖轉(zhuǎn)錄組分析研究的基礎(chǔ)上,對篩選到的微型塊莖誘導(dǎo)形成的潛在相關(guān)基因DoBBX6和DoBBX17進(jìn)行克隆,并對其序列、蛋白結(jié)構(gòu)及生化特性進(jìn)行深入分析;為進(jìn)一步研究基因的功能,分別構(gòu)建了RNAi和過表達(dá)載體,并將過表達(dá)載體轉(zhuǎn)入馬鈴薯中。研究結(jié)果如下:
2、 1.DoBBX6和DoBBX17的克隆及序列分析
采用RACE技術(shù)從微型塊莖中分離到了DoBBX6和DoBBX17基因cDNA全長。DoBBX6基因cDNA全長1332bp,開放閱讀框長1041bp,共編碼347個氨基酸,在N端有兩個串聯(lián)的B-box保守結(jié)構(gòu)域,在C端有一個CCT結(jié)構(gòu)域;DoBBX17基因cDNA全長為1811bp,開放閱讀框長1281bp,共編碼427個氨基酸,在N端含一個B-box保守結(jié)構(gòu)域,在C端有一
3、個CCT結(jié)構(gòu)域,這兩個基因編碼的氨基酸與其他植物具有較高的一致性,均屬于C2C2型鋅指蛋白基因。
2.DoBBX6和DoBBX17蛋白結(jié)構(gòu)分析
DoBBX6和DoBBX17蛋白的初級結(jié)構(gòu)均為酸性親水蛋白,二級結(jié)構(gòu)均以無規(guī)則卷曲、α螺旋結(jié)構(gòu)為主,兩者均不含跨膜區(qū)、信號肽,亞細(xì)胞定位預(yù)測均定位在細(xì)胞核中,且在C端CCT結(jié)構(gòu)域中含有核定位相關(guān)的NLS序列。DoBBX6蛋白無序化的比例為22.5%,DoBBX17蛋白無序化比
4、例為45.4%,且CCT結(jié)構(gòu)域均存在于蛋白的最大無序化區(qū)域內(nèi),DoBBX6和DoBBX17蛋白均存在多個潛在的磷酸化位點。這兩個鋅指蛋白作為核轉(zhuǎn)錄因子,利用生物信息學(xué)方法預(yù)測其主要在轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、生長因子等方面發(fā)揮調(diào)控作用。
3.DoBBX6和DoBBX17蛋白的生化特性分析
采用瞬時轉(zhuǎn)化煙草的方法將DoBBX6、DoBBX17蛋白定位在細(xì)胞核中;通過酵母轉(zhuǎn)錄激活系統(tǒng)研究表明二者均具有轉(zhuǎn)錄激活活性,但其保守結(jié)構(gòu)域B
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