GATA4基因在漢族房室隔缺損患者中的突變分析及功能分析.pdf

1、目的：通過檢測心臟發(fā)育中的重要轉(zhuǎn)錄因子GATA4基因在房室隔缺損（AVSD）患者中的突變情況以及應(yīng)用生物信息學方法預(yù)測突變點對蛋白功能的影響，探討其在先天性房室隔缺損發(fā)病機制中的作用。
　　 方法：收集61例漢族AVSD患者和100例漢族正常人對照組的血液標本，應(yīng)用PCR方法擴增GATA4基因6個編碼外顯子的序列和兩側(cè)各50個堿基以上序列，并對擴增產(chǎn)物進行測序。將患者擴增的GATA4基因編碼序列與GenBank人GATA4基因編

2、碼序列進行比對，并與正常人對照組比較，觀察GATA4突變情況。采用統(tǒng)計學方法比較在AVSD合并21-三體綜合征與非合并21-三體綜合征的患者中檢出GATA4的突變率有無差異。利用生物信息學的方法（SIFT）預(yù)測基因突變可能對GATA4蛋白功能的影響。
　　 結(jié)果：
　　 1.在61例患者（包括合并21-三體綜合征7例，非綜合征病例54例）中檢出2例錯義突變（堿基變化為C106G、A1129G，氨基酸改變分別為P36A、S

3、377G），兩例均為非21-三體綜合征AVSD患者。
　　 2.GATA4基因編碼第36 位脯氨酸和第377位絲氨酸在生物進化過程中均處于高度保守。
　　 3.GATA4突變率在AVSD合并21-三體綜合征（0/7）與非合并21-三體綜合征（2/54）的患者中的比較，采用Fisher’s確切概率法，P=0.782（P>0.05），兩組突變率的差異無統(tǒng)計學意義。
　　 4.利用SIFT程序預(yù)測GATA4基因P36A

4、點突變概率P值是0.00（P<0.05），S377G點突變概率P值是0.63（P>0.05）。
　　 結(jié)論：
　　 1.本實驗發(fā)現(xiàn)的兩例錯義突變，僅存在于AVSD患者中，在對照組中不存在，提示GATA4的基因突變可能與AVSD發(fā)病相關(guān)。
　　 2.合并21-三體綜合征與非合并21-三體綜合征的AVSD患者GATA4檢出的突變率無明顯差異。
　　 3.GATA4基因在AVSD患者中突變率低，提示AVSD可能