GATA4基因在漢族房室隔缺損患者中的突變分析及功能分析.pdf

1、目的：通過檢測心臟發(fā)育中的重要轉(zhuǎn)錄因子GATA4基因在房室隔缺損（AVSD）患者中的突變情況以及應用生物信息學方法預測突變點對蛋白功能的影響，探討其在先天性房室隔缺損發(fā)病機制中的作用。
　　 方法：收集61例漢族AVSD患者和100例漢族正常人對照組的血液標本，應用PCR方法擴增GATA4基因6個編碼外顯子的序列和兩側各50個堿基以上序列，并對擴增產(chǎn)物進行測序。將患者擴增的GATA4基因編碼序列與GenBank人GATA4基因編

2、碼序列進行比對，并與正常人對照組比較，觀察GATA4突變情況。采用統(tǒng)計學方法比較在AVSD合并21-三體綜合征與非合并21-三體綜合征的患者中檢出GATA4的突變率有無差異。利用生物信息學的方法（SIFT）預測基因突變可能對GATA4蛋白功能的影響。
　　 結果：
　　 1.在61例患者（包括合并21-三體綜合征7例，非綜合征病例54例）中檢出2例錯義突變（堿基變化為C106G、A1129G，氨基酸改變分別為P36A、S

3、377G），兩例均為非21-三體綜合征AVSD患者。
　　 2.GATA4基因編碼第36 位脯氨酸和第377位絲氨酸在生物進化過程中均處于高度保守。
　　 3.GATA4突變率在AVSD合并21-三體綜合征（0/7）與非合并21-三體綜合征（2/54）的患者中的比較，采用Fisher’s確切概率法，P=0.782（P>0.05），兩組突變率的差異無統(tǒng)計學意義。
　　 4.利用SIFT程序預測GATA4基因P36A

4、點突變概率P值是0.00（P<0.05），S377G點突變概率P值是0.63（P>0.05）。
　　 結論：
　　 1.本實驗發(fā)現(xiàn)的兩例錯義突變，僅存在于AVSD患者中，在對照組中不存在，提示GATA4的基因突變可能與AVSD發(fā)病相關。
　　 2.合并21-三體綜合征與非合并21-三體綜合征的AVSD患者GATA4檢出的突變率無明顯差異。
　　 3.GATA4基因在AVSD患者中突變率低，提示AVSD可能