超級(jí)雜交稻兩優(yōu)培九EREBP cDNA的生物信息學(xué)分析與克隆.pdf

1、超級(jí)雜交稻是在我國(guó)種植面積極廣的一種糧食作物，目前我國(guó)的超級(jí)雜交稻在超高產(chǎn)育種領(lǐng)域已取得了令世界矚目的成就。乙烯反應(yīng)元件結(jié)合蛋白與植物生長(zhǎng)發(fā)育、抗病和抗逆性等一些重要生理生化反應(yīng)的基因調(diào)控有著密切的關(guān)系，近年來已成為研究的熱點(diǎn)，并取得了一定進(jìn)展。生物信息學(xué)結(jié)合分子生物學(xué)、遺傳學(xué)等生物技術(shù)手段，為研究乙烯反應(yīng)元件結(jié)合蛋白提供了幫助。 本研究以生物信息學(xué)的分析為基礎(chǔ)，利用模式植物擬南芥中編碼乙烯反應(yīng)元件結(jié)合蛋白的cDNA，對(duì)現(xiàn)有的水

2、稻基因組數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行搜索，獲得一條高同源的未知序列。通過對(duì)這條未知序列的核酸序列和蛋白質(zhì)序列、結(jié)構(gòu)、性質(zhì)、功能等方面的一系列生物信息學(xué)分析，表明未知序列應(yīng)為水稻中編碼乙烯反應(yīng)元件結(jié)合蛋白的eDNA。以超級(jí)雜交稻為材料，提取總RNA并反轉(zhuǎn)錄成eDNA，用未知序列設(shè)計(jì)一對(duì)簡(jiǎn)并引物，經(jīng)PCR擴(kuò)增出編碼乙烯反應(yīng)元件結(jié)合蛋白的eDNA片段，eDNA片段經(jīng)T-A克隆后進(jìn)行測(cè)序，獲得一條長(zhǎng)915bp的eDNA片段，BLAST表明未知序列的部分核酸序列與