胞外多肽的生物信息學(xué)分析與應(yīng)用.pdf

1、長(zhǎng)期以來(lái)人們一直認(rèn)為植物的細(xì)胞壁是支持植物細(xì)胞和植物體的剛性結(jié)構(gòu)，大分子的多肽類(lèi)分子不可能作為細(xì)胞間信使存在。但研究發(fā)現(xiàn)植物和動(dòng)物一樣也可能利用多肽類(lèi)激素來(lái)調(diào)節(jié)植物的生長(zhǎng)發(fā)育和逆境防御反應(yīng)。目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了多種植物胞外多肽信號(hào)分子，但其中關(guān)于受體和細(xì)胞內(nèi)信號(hào)通路研究比較明確的只有四種。基因組研究發(fā)現(xiàn)模式動(dòng)物的基因組中含有編碼RLKs基因數(shù)分別為人類(lèi)70個(gè)、線(xiàn)蟲(chóng)43個(gè)、果蠅25個(gè)，并有大量的胞外多肽類(lèi)信號(hào)分子與之對(duì)應(yīng)，在植物中擬南芥的基因組

2、中編碼RLKs的基因數(shù)為417個(gè)，在水稻的基因組中數(shù)量更大于600個(gè)，應(yīng)當(dāng)存在更多的胞外多肽信使與之對(duì)應(yīng)。本文通過(guò)運(yùn)用生物信息學(xué)的方法，利用豐富的動(dòng)物胞外多肽的信息，分析比較了已知的植物、動(dòng)物及微生物的胞外多肽的氨基酸序列和結(jié)構(gòu)特征，發(fā)現(xiàn)這些來(lái)自不同種的胞外多肽具有共同的氨基酸偏好特征、結(jié)構(gòu)特征和相似的疏水性特征，并利用在線(xiàn)工具對(duì)胞外多肽的氨基酸偏好特征進(jìn)行了驗(yàn)證，利用這些共同特征對(duì)植物中新的胞外多肽進(jìn)行了推斷，推斷了已知植物胞外多肽的