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文檔簡介
1、目的:
1.收集母系遺傳2型糖尿病家系,通過高通量捕獲測序技術(shù)對其線粒體全基因組DNA進(jìn)行捕獲測序,并定性和定量分析其2型糖尿病相關(guān)異質(zhì)性突變位點(diǎn);
2.EB病毒轉(zhuǎn)化先證者外周血B淋巴細(xì)胞,建立A3243G突變永生細(xì)胞株后通過單細(xì)胞篩選,建立相同核背景下不同異質(zhì)水平的A3243G突變永生細(xì)胞株,并研究mtDNA A3243G異質(zhì)性突變與線粒體功能的關(guān)系。
3.為檢測永生細(xì)胞株線粒體DNA A3243G突變異
2、質(zhì)水平建立一種簡便但相對準(zhǔn)確敏感的定量檢測方法。
對象與方法:
1.標(biāo)本采集:病例收集依托溫州醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院內(nèi)分泌科室。收集1個(gè)母系遺傳2型糖尿病家系(共12人),同時(shí)采集12人外周血進(jìn)行常規(guī)生化指標(biāo)檢測并詢問記錄基本臨床資料。
2.提取母系家庭成員(n=12人)外周血總DNA,調(diào)整其純度和濃度后送往北京邁基諾測序公司進(jìn)行線粒體全基因組高通量捕獲測序,并對所有測序結(jié)果進(jìn)行整理,分析2型糖尿病相關(guān)線粒體
3、DNA異質(zhì)性突變位點(diǎn)及其母系遺傳特點(diǎn)。
3.采集母系遺傳2型糖尿病家系先證者外周血和1例相同單體型健康人的外周血,通過EB病毒轉(zhuǎn)化,建立永生細(xì)胞系。并根據(jù)有限稀釋法,制備不同異質(zhì)水平的mtDNA A3243G突變永生細(xì)胞株。
4.為了隨時(shí)方便檢測永生細(xì)胞株mtDNA A3243G異質(zhì)性突變水平,建立并完善實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)合阻滯形成系統(tǒng)技術(shù)(RT-ARMs-qPCR)。
5.利用流式細(xì)胞技術(shù)、激光共聚焦技
4、術(shù)、高效液相色譜技術(shù)和透射電鏡技術(shù)對不同異質(zhì)水平永生細(xì)胞株和對照永生細(xì)胞株分別進(jìn)行細(xì)胞內(nèi)活性氧水平(ROS)、線粒體數(shù)量、線粒體膜電位、細(xì)胞凋亡率、細(xì)胞內(nèi)三磷酸腺苷水平(ATP)、線粒體形態(tài)檢測,并統(tǒng)計(jì)分析其差異。
結(jié)果:
1.經(jīng)過線粒體全基因組高通量捕獲測序技術(shù)共檢測到41個(gè)同質(zhì)性突變位點(diǎn),經(jīng)過氨基酸比對和不同物種間的保守性分析后,可以排除這41個(gè)同質(zhì)性突變位點(diǎn)的糖尿病致病作用;同時(shí)檢測出5個(gè)高異質(zhì)水平突變位點(diǎn)(>
5、10%),包括致病性突變位點(diǎn)A3243G和非致病性突變位點(diǎn)C150T、T152C、T4823C、G7600A。
2.本家系母系成員線粒體DNA A3243G異質(zhì)水平為11%-73%,而不同年齡段所攜帶不同水平突變,40歲以上為15%左右,而20歲-30歲異質(zhì)水平介于11%-73%,經(jīng)統(tǒng)計(jì)學(xué)相關(guān)性分析y=-0.01x+0.67。
3.建立和完善mtDNA A3243G突變異質(zhì)水平的檢測方法,在做相關(guān)性分析后,得出相關(guān)系
6、數(shù)R2=0.998,同時(shí)檢測本家系A(chǔ)3243G突變攜帶者外周血mtDNA突變異質(zhì)性,其檢測結(jié)果與高通量測序結(jié)果差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
3.通過EB病毒轉(zhuǎn)化,成功建立A3243G突變永生細(xì)胞株和正常對照永生細(xì)胞株。
4.根據(jù)有限稀釋法,得到兩種不同異質(zhì)的永生細(xì)胞株(80%和95%);通過線粒體功能檢測發(fā)現(xiàn),永生細(xì)胞株內(nèi)A3243G突變異質(zhì)水平在80%時(shí),除細(xì)胞內(nèi)ATP水平以外的其他檢測,如ROS、膜電位、凋亡率與正常對照永
7、生細(xì)胞株差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;而95%異質(zhì)水平的永生細(xì)胞株其線粒體功能包括細(xì)胞內(nèi)ATP水平的其他檢測與正常對照永生細(xì)胞株的差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
5.透射電鏡結(jié)果顯示,A3243G突變永生細(xì)胞株與正常對照永生細(xì)胞株的線粒體相比,出現(xiàn)融合和分裂異常。
結(jié)論:
1.成功構(gòu)建線粒體全基因組高通量測序技術(shù)平臺(tái),通過對母系遺傳2型糖尿病家系的線粒體全基因組DNA檢測發(fā)現(xiàn)除A3243G異質(zhì)性突變以外沒有其它病理性突變位點(diǎn)。
8、
2.mtDNAA3243G突變異質(zhì)水平低于15%的情況下,可以突破生殖細(xì)胞的遺傳瓶頸傳遞給后代;同時(shí),mtDNA A3243G突變異質(zhì)水平與年齡成負(fù)相關(guān)。
3.RT-ARMs-qPCR技術(shù)檢測mtDNAA3243G突變異質(zhì)水平是可靠的,可以用于永生細(xì)胞株mtDNA A3243G突變異質(zhì)水平的檢測。
4.mtDNAA3243G突變永生細(xì)胞株異質(zhì)水平在80%時(shí),其線粒體氧化磷酸化功能未受損,其原因可能是由于線
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