葡萄bHLH與森林草莓NBS-LRR基因的全基因組分析.pdf

1、果樹遺傳育種是果樹抵抗各種逆境脅迫最有效的方法之一，深入探究果樹抗脅迫基因的進(jìn)化模式，對果樹抗脅迫基因合理、高效的利用，抗性品種開發(fā)以及優(yōu)良品種種質(zhì)資源的保存均具有十分重要的意義。
　　bHLH基因是真核生物轉(zhuǎn)錄因子中數(shù)量最多的一類。NBS-LRR基因是植物抗病基因家族中最大的一類。研究這兩類基因?qū)τ谥参锏倪z傳育種有著推動作用，然而關(guān)于葡萄bHLH和草莓NBS-LRR基因進(jìn)化模式的研究還很少。
　　本文通過生物信息學(xué)分析，鑒

2、定得到110個葡萄的bHLH基因，分別命名為VvbHLH001-VvbHLH110。葡萄bHLH基因可以分為24個亞家族，以非隨機(jī)的方式分布在19條染色體上，其中有9組基因發(fā)生了串聯(lián)復(fù)制?；蛐酒磉_(dá)分析顯示葡萄bHLH基因具有器官特異性表達(dá)，如亞家族Ib(2)在根中特異表達(dá)，可能與根活力有關(guān);VvbHLH003和VvbHLH16基因在花蕊及花序中特異表達(dá)，推測與花器官發(fā)育有關(guān)。Vvb HLH039和參與ABA，JA和光信號傳導(dǎo)的MYC

3、2(ATlG32640)序列相似性較高，由此可推測VvbHLH039可能參與抗逆脅迫過程。
　　此外，本文還系統(tǒng)地研究了森林草莓的NBS-LRR基因，鑒定得到144個NBS-LRR基因，其中non-TNL基因的數(shù)目要多于TNL基因，Ka/Ks值分析顯示它們大部分都受負(fù)選擇調(diào)控，只有少數(shù)基因發(fā)生適應(yīng)性進(jìn)化，說明大部分基因?yàn)榱诉m應(yīng)環(huán)境，受到了更強(qiáng)制性的自然約束。草莓NBS-LRR基因發(fā)生過明顯的基因復(fù)制，且大多數(shù)基因?yàn)槲锓N特異性復(fù)制。