鉤體56602株全基因組測序及比較基因組分析.pdf

1、目的：
　　本文第一部分中，主要對鉤端螺旋體56602株進(jìn)行了全基因組測序及比較基因組分析，以期發(fā)現(xiàn)博氏鉤體56602株毒力減弱的原因，及其對環(huán)境的適應(yīng)性，補(bǔ)充鉤體基因組數(shù)據(jù)庫。
　　方法：
　　我們通過454焦磷酸測序結(jié)合Sanger測序技術(shù)，完成了56602株全基因組測序；然后，我們將其與已完成全基因組測序的五株鉤體，博氏鉤體L550株，JB197株,56604株，問號鉤體56601株以及雙曲鉤體Ames株運(yùn)用生物

2、信息學(xué)等方法進(jìn)行比較基因組分析。
　　結(jié)果及結(jié)論：
　　博氏鉤體56602株有兩個環(huán)狀染色體，共編碼2372個蛋白。與博氏鉤體L550株及JB197株相比，56602株的染色體分別小4.6%及3.2%，此外，56602株基因組中的插入序列遠(yuǎn)少于這兩株博氏鉤體，且僅有一個位于小染色體上的插入序列是完整拷貝。56602株的O抗原基因簇由108個基因組成，通過序列同源性比較分析發(fā)現(xiàn)，其中62個基因可能是通過水平轉(zhuǎn)移從問號鉤體中得到

3、的。此外，還有三個基因簇也可能是從問號鉤體中通過水平轉(zhuǎn)移得到的。毒力相關(guān)蛋白，比如Lig表面蛋白，溶血素，鞘磷脂酶，富含亮氨酸的蛋白，纖維連接蛋白，胰蛋白酶樣絲氨酸蛋白酶，LfhA蛋白，Loa22蛋白，脂蛋白或者外膜蛋白；信號轉(zhuǎn)導(dǎo)蛋白或者環(huán)境適應(yīng)相關(guān)蛋白，這些蛋白相應(yīng)編碼基因的缺失或突變，可能導(dǎo)致56602株形成毒力的減弱及嚴(yán)格的宿主間傳播途徑。
　　目的：
　　本文的第二部分主要研究載銀載抗生素納米顆粒的抗菌活性。