青枯菌基因組分析.pdf

1、 青枯菌(Ralstonia solanacearum)是一種危害嚴(yán)重的土傳植物致病菌，它具有非常廣泛的宿主范圍，在世界各地都有分布。青枯菌是植物病害分子機理研究中的一個重要的模式生物。我們應(yīng)用ZCURVE、Glimmer、Zplotter等軟件對青枯菌的基因組進行了詳細分析。我們對青枯菌及另外五種高GC含量的革蘭氏陰性植物致病菌進行了基因的預(yù)測高表達(PHX)分析。其它病菌包括根癌土壤桿菌、十字花科黑腐病菌、地毯草黃單胞菌、丁香

2、假單胞桿菌、苛養(yǎng)木桿菌。結(jié)果顯示，能量代謝途徑中的酶 類，如ATP合成酶和三羧酸循環(huán)中的各種因子在除苛養(yǎng)木桿菌之外的其它細菌中是預(yù)測高表達的，這與苛養(yǎng)木桿菌兼營厭氧和需氧發(fā)酵有關(guān)。大多數(shù)毒力相關(guān)因子，包括鞭毛蛋白和部分外膜蛋白，除了苛養(yǎng)木桿菌不具備鞭毛外都屬于高表達基因。三型分泌系統(tǒng)結(jié)構(gòu)蛋白雖然與鞭毛蛋白具有一定的同源性，但不是預(yù)測高表達基因，這說明三型分泌系統(tǒng)結(jié)構(gòu)蛋白與鞭毛蛋白在進化上是相互分離的。另外，一些特定的生物合成酶類是