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1、根據(jù)本實(shí)驗(yàn)室構(gòu)建的鴨瘟病毒(DPV) CHv株基因文庫及其測(cè)定的序列信息,設(shè)計(jì)了UL41基因引物,PCR擴(kuò)增出鴨瘟病毒CHv株UL41基因(GenBank登錄號(hào)EU071040),對(duì)UL41基因的分子特征和稀有密碼子使用情況等做了一系列生物信息學(xué)分析,對(duì)UL41基因進(jìn)行原核表達(dá)、蛋白純化和抗體制備、轉(zhuǎn)錄時(shí)相分析以及UL41蛋白的亞細(xì)胞定位研究,獲得如下結(jié)果:
1.鴨瘟病毒UL41基因序列的分子特性分析
DPV UL4
2、1基因大小為1497bp,編碼498個(gè)氨基酸(aa)。根據(jù)信號(hào)肽、跨膜區(qū)及磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)揭示UL41基因編碼的蛋白既沒有信號(hào)肽也沒有跨膜區(qū),片段有24個(gè)潛在磷酸化位點(diǎn)。通過對(duì)該基因編碼蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)分析發(fā)現(xiàn)無規(guī)則卷曲和α螺旋比例較大,三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn)與Flap endonuclease-1(FEN-1)有同源性。此外,進(jìn)化樹分析發(fā)現(xiàn)該基因?qū)儆隈R立克皰疹病毒屬,與MeHV-1、GaHV-2和GaHV-3進(jìn)化關(guān)系最近。
2.U
3、L41基因的克隆、原核表達(dá)、蛋白純化及抗體制備
設(shè)計(jì)一對(duì)引物,PCR擴(kuò)增了一條長(zhǎng)度為1526bp的DNA片段,此片段囊括了完整的UL41基因開放閱讀框(ORF),將此片段插入pMD19-T載體,構(gòu)建重組質(zhì)粒pMD19-T-UL41。通過EcoRⅠ和XhoⅠ雙酶切pMD19-T-UL41重組質(zhì)?;厥漳康钠?,再將該目的片段定向插入pET-32a(+)原核表達(dá)載體,構(gòu)建重組質(zhì)粒pET-32a(+)-UL41。菌液PCR、EcoRⅠ
4、和XhoⅠ雙酶切及測(cè)序鑒定重組表達(dá)質(zhì)粒pET-32a(+)-UL41正確與否。將鑒定正確的重組表達(dá)質(zhì)粒轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞誘導(dǎo)表達(dá)。重組表達(dá)菌在IPTG的誘導(dǎo)下成功表達(dá)得到與預(yù)期大小相同的76kDa6×His重組融合蛋白,此蛋白主要以包涵體形式存在。UL41蛋白最優(yōu)表達(dá)條件為30℃搖菌培養(yǎng)加入0.2mmol/L IPTG誘導(dǎo)10h。重組UL41蛋白的Western-blot檢測(cè)說明其能被兔抗DPV陽性血清識(shí)別。重組U
5、L41蛋白純化后用于制各兔抗UL41多克隆抗體,瓊脂糖擴(kuò)散實(shí)驗(yàn)效價(jià)為1∶8。該多克隆抗體Western-blot檢測(cè)表明能特異識(shí)別表達(dá)的UL41重組蛋白。
3.DPV UL41基因轉(zhuǎn)錄時(shí)相
DPV感染宿主鴨胚成纖維細(xì)胞后,利用熒光定量PCR相對(duì)定量法檢測(cè)UL41基因轉(zhuǎn)錄的情況,試驗(yàn)中利用SYBR GreenⅠ作為熒光染料檢測(cè)不同時(shí)間段收取的細(xì)胞樣品。結(jié)果顯示UL41基因6h開始出現(xiàn)轉(zhuǎn)錄,36h達(dá)到最高峰,54h仍有轉(zhuǎn)
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