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文檔簡介
1、先天性心臟傳導阻滯（CHB）是一種完全性房室傳導阻滯，這種疾病嚴重危害胎兒健康。據(jù)估計會影響到1/5,500的孕婦（50％胎兒死亡率）和1/11,000的新生兒，并導致患兒終身需要靠心臟起搏器生活。研究該病相關(guān)藥物靶點能夠加快該病相關(guān)藥物的研發(fā)速度、極大的推動CHB的靶向治療，同時更好的闡明該病病理。
本文構(gòu)建了與先天性心臟傳導阻滯直接相關(guān)的陽性集和該病的候選陰性集，兩個集合都由基因和蛋白相關(guān)信息構(gòu)成。首先，通過網(wǎng)絡數(shù)據(jù)平臺利
2、用文本挖掘就目前研究較多可信度高的該病相關(guān)蛋白進行了信息整合，構(gòu)建了該病相關(guān)的陽性集。其次，利用PubMed、OMIM查找該病與房室心律失常、心臟衰竭間存在的疾病關(guān)聯(lián)，將通過疾病間關(guān)聯(lián)分析研究復雜疾病的報道為理論依據(jù)，在DrugBank數(shù)據(jù)庫中間接尋找該病相關(guān)潛在藥物靶點，構(gòu)建了該病的候選陰性集。
通過兩個集合間基因語義相似性計算比較，以及ENDEAVOUR數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)注釋達到了優(yōu)化該病相關(guān)潛在藥靶蛋白的目的。結(jié)果，預測了20個
3、潛在藥物靶點。隨后，使用GENECODIS對預測出的20個潛在藥物靶點的藥靶蛋白及相應基因做了GO功能、相關(guān)通路和MicroRNA、SNP的富集分析。本文通過研究發(fā)現(xiàn)20個潛在藥物靶點的功能較多集中在門控離子通道活性、轉(zhuǎn)運活性、信號傳導活性、離子轉(zhuǎn)運活性和離子通道活性；候選陰性集中基因富集到最多的一條通路是（KEGG）04020的鈣信號傳導通路，與之前類似研究結(jié)果相符。其次，還找到富集效果較好之前未有報道的（KEGG）04010的MAP
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