甘肅不同產(chǎn)區(qū)栽培當(dāng)歸群體遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)研究.pdf_第1頁(yè)
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1、目的:建立適用于當(dāng)歸的ISSR-PCR最佳反應(yīng)體系,對(duì)不同產(chǎn)區(qū)栽培當(dāng)歸居群進(jìn)行遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)研究。
  方法:采用正交試驗(yàn)設(shè)計(jì)和單因素試驗(yàn)設(shè)計(jì)對(duì)反應(yīng)體系中各種影響因素進(jìn)行優(yōu)化,應(yīng)用優(yōu)化后體系對(duì)41個(gè)不同居群栽培當(dāng)歸樣本進(jìn)行 ISSR-PCR擴(kuò)增,利用 Popgen1.32軟件分析 Shannon's多樣性信息指數(shù)(I)等遺傳信息參數(shù),應(yīng)用 NTSYS軟件構(gòu)建其遺傳距離的 UPGMA聚類圖,并對(duì)統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)進(jìn)行遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)

2、分析。
  結(jié)果:最佳反應(yīng)體系(20μL)為:10×PCR Buffer(Mg2+ Plus)2.0 mmol/L,Taq DNA聚合酶1.5 U,dNTPs0.25 mmol/L,Primer0.4μmol/L以及 Template DNA30 ng;篩選出6條擴(kuò)增條帶較多、背景清晰的引物對(duì)41個(gè)居群的804個(gè)栽培當(dāng)歸樣品進(jìn)行 PCR擴(kuò)增,共檢測(cè)到54個(gè)位點(diǎn),其中多態(tài)性位點(diǎn)46個(gè),多態(tài)性比率為85.19%,Shannon's信息

3、指數(shù)(I)平均值為0.4436,Nei's基因多樣度(H)平均值為0.2999;通過 Popgen軟件分析得到栽培當(dāng)歸居群的 Ht為0.3012,Hs為0.0204,根據(jù) Ht和 Hs來計(jì)算 Gst為0.9322,居群間基因流估計(jì)值 Nm為0.0364;不同產(chǎn)區(qū)的栽培當(dāng)歸之間遺傳距離的變異范圍是0.3994-1.0000。
  結(jié)論:建立的當(dāng)歸 ISSR-PCR反應(yīng)體系可用于當(dāng)歸分子遺傳學(xué)研究;各指數(shù)均顯示出甘肅栽培當(dāng)歸遺傳多樣性

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