比較基因組雜交技術分析橫紋肌肉瘤中染色體基因組的變化及意義.pdf

1、目的：探討橫紋肌肉瘤的基因組變化特征,比較不同融合基因表達類型、不同組織學分型、不同組織學分級以及不同臨床病理分期橫紋肌肉瘤的基因組變化差異。 方法：選用石河子大學附屬醫(yī)院和新疆維吾爾自治區(qū)人民醫(yī)院外科手術切除并經(jīng)病理組織學證實的25例原發(fā)性橫紋肌肉瘤(RMS)標本,其中腺泡狀橫紋肌肉瘤(ARMS)10例,胚胎性橫紋肌肉瘤(ERMS)12例,多形性橫紋肌肉瘤(PRMS)3例。在一步法RT-PCR檢測所有標本中PAX3/7-FKH

2、RmRNA融合基因表達情況的基礎上,應用比較基因組雜交技術(CGH)分析RMS基因組的變化；根據(jù)融合基因表達情況、組織學分型、臨床分期、組織學分級、性別和年齡分組,并比較不同分組的基因組變化差異。同時收集RMS細胞株A204(腺泡型)、RD(胚胎型)作為對照。所有數(shù)據(jù)資料運用SPSS13.0軟件包分析。 結果：25例RMS CGH分析結果顯示： (1)所有RMS染色體基因組均發(fā)生不同程度的變化,其中擴增最常見的是12q(

3、48％),2p(44％),8q(40％),10q(40％),1p(36％),6p(36％),9q(36％)和2q(32％),6q(32％),15q(32％),18q(32％),其中最常累及的染色體區(qū)段為2p24(36％),12q13(32％),9q21-22(28％)和6p23-ter(20％)；而缺失最常見的是3p(48％),6p(36％)和；11p(36％) (2)10例ARMS中,擴增最常見的是12q(70％),2p(50

4、％),6(50％),2q(40％),4q(40％),10q(40％)和15q(40％);缺失最常見的是3p(50％),6p(50％),1q(40％),5q(40％)；12例ERMS中,擴增最常見的是7p(50％),9q(50％),18q(50％),2p(42％)和1p(33％),8q(33％)；缺失最常見的是11p(42％)。12q13擴增在這兩組間的差異有統(tǒng)計學意義,并多見于ARMS; (3)8例融合基因表達陽性的RMS中,擴

5、增最常見的是12q(87.5％),2p(50％),6(50％),2q(50％),10q(50％),4q(37.5％)和15q(37.50),缺失最常見的是3p(50％),6p(50％),5q(50％),1q(37.5％)；而其余融合基因表達陰性的RMS中,擴增最常見的是2p(41％),9q(41％),18q(41％),7p(35％)和8q(35％)?；蚪M缺失最常見的是11p(35％)和14q(35％)。其中12q13擴增在兩組間的差異

6、有統(tǒng)計學意義,并多見于伴有融合基因的RMS。 (4)在不同臨床分期中,9q擴增在II期和Ⅲ～IV期間差異有統(tǒng)計學意義,且多見于II期患者。 (5)6p擴增在組織學3級和臨床3-4期發(fā)生頻率較高。 (6)細胞株染色體基因組最常見的變化與RMS組織相似,包括2p22-24,12q12-14,9q21-22擴增與6p22-23,11p12-14缺失。 結論： (1)染色體2p,12q,6p,9q,10q