綿羊多胎性狀差異表達microRNA的篩選與靶基因驗證.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、小尾寒羊產羔率高,平均產羔率為281.9%,而吐魯番黑羊是典型的產單羔綿羊,單羔率為99.3%。多胎性狀是綿羊的重要經(jīng)濟性狀之一,是決定繁殖率的關鍵因素之一。然而,多胎性狀是受多基因控制的且遺傳力低,利用傳統(tǒng)的選擇方法培育新的高繁殖率品種是相當繁瑣的。構建小尾寒羊和吐魯番黑羊卵巢組織miRNA表達譜,篩選與綿羊多胎性狀相關的miRNAs,為培育新高繁殖率品種提供新的方向。
  本研究采用高通量測序技術,構建了小尾寒羊和吐魯番黑羊發(fā)

2、情期、間情期四個卵巢組織樣品的miRNA cDNA庫。結果表明:四個樣品組織分別獲得了11467290、10667271、11133001、10793522條純凈reads;對這些reads進行長度分布統(tǒng)計,在22nt處達到峰值;采用miRDeep程序對測序結果進行分析,在四個卵巢樣品中分別獲得194、191、188、187個miRNAs,其中已知miRNA分別為135、134、136、129個,未知miRNA分別為59、57、52、5

3、8個;oar-miR-99a是小尾寒羊間情期表達量最為豐富的miRNA,而oar-miR-143是小尾寒羊發(fā)情期、吐魯番黑羊發(fā)情期和間情期三個樣品中表達量最豐富的miRNA。通過對同一個體發(fā)情期和間情期表達的miRNAs進行比較,篩選出小尾寒羊發(fā)情期與間情期中3個顯著差異表達的miRNAs(log2Foldchange<-1),吐魯番黑羊發(fā)情期與間情期存在19個顯著差異表達miRNAs(log2Foldchange<-1),對其靶基因進

4、行GO富集和KEGG通路分析,推測差異表達的miRNAs通過代謝和免疫途徑調控綿羊相關的繁殖過程;通過多胎與單胎羊之間的比較,篩選出小尾寒羊與吐魯番黑羊間情期之間34個差異表達的miRNAs(log2Foldchange<-1),推測這些miRNAs與綿羊多胎性狀相關,為培育新的高繁殖率品種提供新的方向和思路。
  采用熒光素酶報告分析實驗對miR-150、miR-27a進行靶基因的驗證。試驗結果表明:StAR基因為miR-150

5、的一個靶基因,而CREB1不是miR-27a的靶基因。StAR為固醇類激素生成過程中重要的限速酶,推測miR-150是通過作用于StAR影響孕酮的生成,從而對綿羊的卵泡發(fā)育、排卵、排卵數(shù)、產羔率產生調節(jié)作用。而miR-27a不是通過CREB1調節(jié)綿羊的繁殖活動。
  利用實時熒光定量PCR檢測oar-miR-23b、oar-miR-200b、oar-miR-150、oar-miR-19b、oar-miR-194、oar-miR-2

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