挖掘癌相關(guān)蛋白的精細(xì)功能并重建癌相關(guān)功能子網(wǎng).pdf

1、目前，人們對癌基因(蛋白)的相關(guān)功能及生物學(xué)通路的認(rèn)識還比較有限，限制了癌癥的研究進(jìn)展。因此，出現(xiàn)了許多利用基因表達(dá)與蛋白質(zhì)互作等關(guān)系來預(yù)測基因與蛋白質(zhì)功能的算法。然而，目前的算法都將焦點(diǎn)放在功能完全未知的蛋白質(zhì)上。事實(shí)上，很多已注釋的癌蛋白的功能知識還很粗泛，因此進(jìn)一步探索這些癌蛋白的細(xì)致功能對探索癌癥的發(fā)病機(jī)制具有重要的意義。對于已知部分功能的癌蛋白，本文提出了一種結(jié)合Gene Ontology功能先驗(yàn)知識和蛋白質(zhì)互作，通過構(gòu)建功能

2、特異的局部互作網(wǎng)絡(luò)來挖掘癌蛋白的細(xì)致功能的方法。在構(gòu)建的功能特異的互作網(wǎng)絡(luò)中，以較高的精確率和覆蓋率將GO中已知部分功能的蛋白質(zhì)預(yù)測到了更為精細(xì)的功能類中。作為應(yīng)用，預(yù)測了口腔癌、肺癌、結(jié)腸癌等相關(guān)癌蛋白的細(xì)致功能。 雖然癌癥是一種高度異質(zhì)的復(fù)雜疾病，其發(fā)生發(fā)展涉及到不同的癌基因，但最終癌蛋白都可能通過改變一些共同的重要功能類而影響癌的發(fā)展。在本工作中，進(jìn)一步擴(kuò)展先前構(gòu)建的功能特異的局部互作網(wǎng)絡(luò)中的蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)，將新的蛋白